19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3509 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3509  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  593  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3653  hypothetical protein  84.62 
 
 		 285 aa  510  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.342414  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2982  hypothetical protein  73.26 
 
 		 287 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.8595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3057  hypothetical protein  73.31 
 
 		 280 aa  441  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0252  hypothetical protein  47.08 
 
 		 290 aa  269  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1310  hypothetical protein  37.5 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0405  hypothetical protein  43.23 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00906691  hitchhiker  0.00328119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1200  hypothetical protein  37.88 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4242  hypothetical protein  49.47 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.272378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  30 
 
 		 484 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0225  hypothetical protein  31.06 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0223  hypothetical protein  31.06 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00452578  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  38.14 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3317  hypothetical protein  24.42 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2516  hypothetical protein  26.32 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3902  hypothetical protein  26.13 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  0.0196844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3264  hypothetical protein  24.66 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1401  hypothetical protein  24.2 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4243  hypothetical protein  37.97 
 
 		 93 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>