34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3151 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3151  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  648    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1128  hypothetical protein  86.17 
 
 		 312 aa  557  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0995  hypothetical protein  57.28 
 
 		 316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2286  hypothetical protein  49.51 
 
 		 317 aa  298  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2381  hypothetical protein  41.11 
 
 		 310 aa  245  8e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2528  hypothetical protein  41.46 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0849  hypothetical protein  39.07 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4745  hypothetical protein  44.35 
 
 		 123 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  33.06 
 
 		 204 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.83 
 
 		 420 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.37 
 
 		 233 aa  45.8  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.74 
 
 		 494 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5006  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.81 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.20351 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  26.38 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2510  regulatory protein  30.52 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0545339  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  31.15 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  27.45 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.91 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  24.22 
 
 		 419 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.38 
 
 		 244 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2780  hypothetical protein  27.42 
 
 		 580 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0442917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0716  cyclopropane fatty acid synthase family protein  25.98 
 
 		 406 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000471122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5666  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.76 
 
 		 395 aa  42.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228934  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  35.23 
 
 		 292 aa  42.7  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>