28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2891 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2891  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  579  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.458702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1380  hypothetical protein  93.14 
 
 		 277 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0478  hypothetical protein  74.73 
 
 		 277 aa  438  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3129  hypothetical protein  70.04 
 
 		 282 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.03549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1768  hypothetical protein  66.06 
 
 		 277 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000246433  hitchhiker  0.00548323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0746  hypothetical protein  64.73 
 
 		 288 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  61.09 
 
 		 281 aa  362  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  61.09 
 
 		 281 aa  362  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  60.95 
 
 		 289 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  60.22 
 
 		 280 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  59.49 
 
 		 280 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  60 
 
 		 281 aa  354  8.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  59.12 
 
 		 288 aa  350  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  58.03 
 
 		 280 aa  340  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02811  conserved hypothetical protein  61.54 
 
 		 189 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02762  hypothetical protein  61.54 
 
 		 189 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0070  hypothetical protein  38.38 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  37.5 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0060  hypothetical protein  38.01 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.218485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  36.67 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  35.29 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4966  hypothetical protein  34.57 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5396  hypothetical protein  34.57 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613339  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  36.56 
 
 		 557 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  30.4 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  28.28 
 
 		 481 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1886  hypothetical protein  24.72 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  26.94 
 
 		 548 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>