30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2620 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2620  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  148  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.635901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1846  hypothetical protein  88.89 
 
 		 72 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  69.01 
 
 		 70 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  69.01 
 
 		 70 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  50.7 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  48.61 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  47.22 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2626  hypothetical protein  67.35 
 
 		 49 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000563687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2137  hypothetical protein  49.3 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  42.25 
 
 		 679 aa  60.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1648  hypothetical protein  40.85 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2413  hypothetical protein  38.89 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1664  hypothetical protein  42.42 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2313  hypothetical protein  39.39 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153075  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1714  hypothetical protein  38.03 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1935  hypothetical protein  40.91 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  36.76 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 573 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  35.21 
 
 		 70 aa  50.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  43.75 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  37.88 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2783  hypothetical protein  36.11 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 573 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 573 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0203  hypothetical protein  35.82 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.699788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2998  imidazoleglycerol-phosphate synthase  36.51 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2660  hypothetical protein  38.81 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4475  hypothetical protein  41.27 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2491  hypothetical protein  35.14 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  40 
 
 		 709 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>