228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1855 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1855  PEBP family protein  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.165132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2143  PEBP family protein  89.52 
 
 		 210 aa  397  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5958  PEBP family protein  75.96 
 
 		 211 aa  345  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4694  PBP family phospholipid-binding protein  76.92 
 
 		 211 aa  346  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4061  protein of unknown function DUF524  63.94 
 
 		 210 aa  286  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0419  PBP family phospholipid-binding protein  60.93 
 
 		 215 aa  275  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0478  PBP family phospholipid-binding protein  62.15 
 
 		 215 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0707  PBP family phospholipid-binding protein  57.89 
 
 		 209 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.148396 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0331  PBP family phospholipid-binding protein  53.85 
 
 		 212 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0957  PEBP family protein  49.04 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206783  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0657  PBP family phospholipid-binding protein  52.88 
 
 		 208 aa  225  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0141  PEBP family protein  50.48 
 
 		 208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6829  PEBP family protein  43.2 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03572  hypothetical protein  45.19 
 
 		 203 aa  184  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196707  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0106  PEBP family protein  46.15 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0330816 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1371  hypothetical protein  41.06 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1305  PEBP family protein  40.1 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.234721  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  32.18 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  29.7 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  28.18 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06342  hypothetical protein  30.05 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  30.69 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  30.2 
 
 		 157 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  29.47 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  28.95 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  28.95 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  27.8 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  29.21 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  29.21 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0102847 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  26.83 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  26.83 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  30.2 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  29.41 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  30.6 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  31.19 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001407  phospholipid-binding protein  28.08 
 
 		 177 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  29.55 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  27.72 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  31.71 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  30.73 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  32.18 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00740  predicted kinase inhibitor  26.11 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0173432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  26.11 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  31.98 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  26.11 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0827  putative kinase inhibitor protein  26.11 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000771777  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  32.18 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  26.11 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0836  putative kinase inhibitor protein  26.11 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  26.11 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  26.11 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5580  PEBP family protein  28.92 
 
 		 173 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  25.62 
 
 		 158 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  28.26 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  29.44 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  32.28 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  26.73 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  27.78 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  26.76 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0279  PBP family phospholipid-binding protein  29.89 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181285 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  27.94 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8937  PEBP family protein  30.6 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.995518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0942  putative kinase inhibitor protein  25.12 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0856  putative kinase inhibitor protein  25.12 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.524056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0828  putative kinase inhibitor protein  25.12 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354915  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0887  putative kinase inhibitor protein  25.12 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0919  putative kinase inhibitor protein  25.12 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0858  PEBP family protein  28.22 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  27.72 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  30.41 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  29.41 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  28.57 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  28.08 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  27.94 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  28.41 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  28.65 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  26.24 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3372  PBP family phospholipid-binding protein  31.21 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00311199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2599  PBP family phospholipid-binding protein  27.71 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0610588  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  26.96 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  26.24 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  31.03 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  27.72 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  29.21 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  28.78 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  29.7 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  28.71 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  29.24 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  28.57 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  28.88 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  27.23 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  33.06 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  26.35 
 
 		 183 aa  62  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  26.24 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  24.63 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  30 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1145  putative kinase inhibitor protein  27.72 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>