27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_14130 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  324  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  92.62 
 
 
160 aa  264  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  64.15 
 
 
159 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  66.23 
 
 
157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  66.23 
 
 
157 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  65.61 
 
 
163 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  65.58 
 
 
157 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3555  hypothetical protein  65.16 
 
 
156 aa  209  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.159937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  61.54 
 
 
158 aa  204  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  60.26 
 
 
158 aa  203  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  64.94 
 
 
157 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  60.26 
 
 
158 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  64.94 
 
 
157 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  64.94 
 
 
157 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  60.9 
 
 
156 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  62.91 
 
 
174 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  61.15 
 
 
163 aa  185  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2797  hypothetical protein  46.41 
 
 
156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0482  hypothetical protein  52.76 
 
 
165 aa  157  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2583  hypothetical protein  41.22 
 
 
158 aa  145  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  47.44 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  48.43 
 
 
171 aa  140  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6429  hypothetical protein  47.68 
 
 
164 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  48.45 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  30.95 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3840  hypothetical protein  27.97 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223195  normal  0.195443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3629  hypothetical protein  32.79 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.456472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>