18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_07430 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_07430  hypothetical protein  100 
 
 
923 aa  1886    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0675  hypothetical protein  91.41 
 
 
908 aa  1724    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0899  hypothetical protein  26.11 
 
 
987 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0750964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0921  hypothetical protein  26.64 
 
 
989 aa  278  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1054  hypothetical protein  25.34 
 
 
991 aa  268  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0439  hypothetical protein  29.13 
 
 
1073 aa  255  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.921499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0393  hypothetical protein  27.59 
 
 
1074 aa  249  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3586  hypothetical protein  28.93 
 
 
1073 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0440  hypothetical protein  27.28 
 
 
1073 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0443  hypothetical protein  28.7 
 
 
1073 aa  244  7e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003968  hypothetical protein  26.12 
 
 
906 aa  241  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0731813  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0418  hypothetical protein  28.73 
 
 
1071 aa  241  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4038  hypothetical protein  28.67 
 
 
1077 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3842  hypothetical protein  28.51 
 
 
1077 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3916  hypothetical protein  28.49 
 
 
1075 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1514  hypothetical protein  26.03 
 
 
660 aa  57.4  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.767692  hitchhiker  0.00000248553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2532  hypothetical protein  23.66 
 
 
770 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09730  hypothetical protein  27.63 
 
 
464 aa  45.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>