More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_05621 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_05621  putative GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 246 aa  510  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0536  GTP cyclohydrolase  99.19 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05921  putative GTP cyclohydrolase I  98.78 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1027  GTP cyclohydrolase  83.88 
 
 		 248 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18971  GTP cyclohydrolase I  83.06 
 
 		 248 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14731  GTP cyclohydrolase I  83.87 
 
 		 248 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0919672 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06001  putative GTP cyclohydrolase I  82.57 
 
 		 248 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0732  GTP cyclohydrolase  74.69 
 
 		 249 aa  388  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1631  GTP cyclohydrolase I  81.57 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07841  putative GTP cyclohydrolase I  81.53 
 
 		 257 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.987944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4119  GTP cyclohydrolase I  56.9 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1830  GTP cyclohydrolase I  55.66 
 
 		 250 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.043372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1074  GTP cyclohydrolase  56.42 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1301  GTP cyclohydrolase I  56.05 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5449  GTP cyclohydrolase I  52.84 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3631  GTP cyclohydrolase  54.05 
 
 		 267 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0869  GTP cyclohydrolase  55.86 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0808  GTP cyclohydrolase I  54.05 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0879  GTP cyclohydrolase  54.05 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.133005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3990  GTP cyclohydrolase I  53.6 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497334  normal  0.07815 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0295  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 		 262 aa  259  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3671  GTP cyclohydrolase  51.82 
 
 		 247 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.773299  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5834  GTP cyclohydrolase I  52.47 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1329  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104361  hitchhiker  0.00333374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0912  GTP cyclohydrolase I  50.21 
 
 		 240 aa  255  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6263  GTP cyclohydrolase I  53.42 
 
 		 223 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3354  GTP cyclohydrolase  36.41 
 
 		 219 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3643  GTP cyclohydrolase I  36.14 
 
 		 226 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0117786  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  31.37 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  33.91 
 
 		 218 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  34.08 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  41.27 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  34.81 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  32.68 
 
 		 201 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  32.68 
 
 		 201 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  32.68 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  30.61 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  33.71 
 
 		 212 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2829  GTP cyclohydrolase I  34.29 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0351357  normal  0.452296 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  34.22 
 
 		 188 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  32.77 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  33.7 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  33.7 
 
 		 206 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  32.97 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  32.6 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  33.03 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  33.52 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  31.69 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  33.03 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  37.11 
 
 		 188 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  31.67 
 
 		 217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  31.87 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  37.43 
 
 		 189 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  40.12 
 
 		 188 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  32.95 
 
 		 217 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  33.52 
 
 		 202 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  35.11 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  36.02 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  32.08 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  34.59 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  31.32 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  32.97 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  34.94 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  35.6 
 
 		 200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  34.38 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  34.07 
 
 		 194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  34.94 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  34.94 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0018  GTP cyclohydrolase I  35.03 
 
 		 182 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00365351  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  34.94 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  34.94 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  34.94 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  34.94 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  36.87 
 
 		 189 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  36.87 
 
 		 189 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  36.87 
 
 		 189 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  36.87 
 
 		 189 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  36.87 
 
 		 189 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  36.87 
 
 		 189 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  34.34 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  28.17 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  36.87 
 
 		 189 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  31.16 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  34.34 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  36.87 
 
 		 189 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  37.29 
 
 		 189 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  36.87 
 
 		 189 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  31.64 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  34.95 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  35.03 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  36.14 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  30.6 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  31.69 
 
 		 188 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  32.84 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  29.85 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  30.6 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  30.6 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  33.69 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  35.96 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  30.6 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>