More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2930 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 182 aa  376  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  91.71 
 
 		 181 aa  350  8.999999999999999e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  70.17 
 
 		 181 aa  288  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  70.17 
 
 		 181 aa  288  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  70.17 
 
 		 181 aa  284  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  69.61 
 
 		 181 aa  284  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  72.47 
 
 		 184 aa  282  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  68.51 
 
 		 181 aa  281  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  68.51 
 
 		 181 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  69.06 
 
 		 181 aa  280  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  70.72 
 
 		 181 aa  280  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  69.66 
 
 		 184 aa  278  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  68.16 
 
 		 187 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  67.6 
 
 		 187 aa  269  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  68.16 
 
 		 185 aa  269  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  67.6 
 
 		 186 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  66.48 
 
 		 186 aa  268  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  67.04 
 
 		 186 aa  266  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  69.14 
 
 		 179 aa  266  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  67.6 
 
 		 179 aa  264  5e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  68.51 
 
 		 181 aa  263  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  67.42 
 
 		 189 aa  263  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  68.51 
 
 		 190 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  66.48 
 
 		 186 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  66.48 
 
 		 186 aa  262  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  67.6 
 
 		 180 aa  262  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  67.04 
 
 		 179 aa  262  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  67.96 
 
 		 181 aa  261  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  65.92 
 
 		 186 aa  260  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  66.29 
 
 		 186 aa  259  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  63.13 
 
 		 198 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  61.67 
 
 		 184 aa  245  3e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  61.67 
 
 		 188 aa  245  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  61.8 
 
 		 185 aa  244  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1044  GTP cyclohydrolase  58.33 
 
 		 203 aa  229  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  61.85 
 
 		 199 aa  229  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  61.27 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  60.23 
 
 		 200 aa  228  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1425  GTP cyclohydrolase I  58.86 
 
 		 203 aa  226  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  58.72 
 
 		 247 aa  225  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  57.56 
 
 		 201 aa  222  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998174  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  55.62 
 
 		 270 aa  222  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  55.87 
 
 		 213 aa  221  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  56.32 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  56.32 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  57.39 
 
 		 195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  55.31 
 
 		 226 aa  218  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  56.65 
 
 		 202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  56.32 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  54.6 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  57.54 
 
 		 203 aa  215  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  55.75 
 
 		 243 aa  214  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  54.6 
 
 		 235 aa  214  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  54.49 
 
 		 199 aa  212  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  54.91 
 
 		 218 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  54.6 
 
 		 235 aa  211  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  53.07 
 
 		 190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  53.45 
 
 		 218 aa  210  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  55.49 
 
 		 329 aa  210  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  54.07 
 
 		 216 aa  210  9e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  52.81 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  52.22 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  52.3 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 		 190 aa  208  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 		 223 aa  207  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  52.3 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  52.51 
 
 		 220 aa  207  8e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  52.3 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 194 aa  207  9e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 210 aa  206  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  52.51 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 193 aa  205  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 		 195 aa  206  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  53.22 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 		 193 aa  204  5e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  51.12 
 
 		 190 aa  204  8e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  52.3 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  50 
 
 		 435 aa  197  5e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  50.9 
 
 		 179 aa  194  8.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  51.98 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 225 aa  184  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  50.54 
 
 		 210 aa  184  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  51.12 
 
 		 224 aa  184  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  47.73 
 
 		 206 aa  180  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  48.33 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  47.78 
 
 		 213 aa  178  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  47.78 
 
 		 188 aa  177  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  48.04 
 
 		 205 aa  177  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  48.33 
 
 		 199 aa  176  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  47.78 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 203 aa  175  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  47.19 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  47.78 
 
 		 193 aa  173  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  48.89 
 
 		 194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  47.19 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  47.43 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  47.43 
 
 		 206 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>