21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_11051 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_11051  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  254  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00522567  normal  0.438958 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09801  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.75 
 
 		 309 aa  115  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1615  hypothetical protein  40 
 
 		 306 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1376  hypothetical protein  34.62 
 
 		 297 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0668  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.27 
 
 		 177 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15001  helix-turn-helix  41.27 
 
 		 177 aa  83.6  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11891  helix-turn-helix  34.55 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11881  helix-turn-helix  31.82 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.50952  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11721  helix-turn-helix  31.82 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.193067  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  34.29 
 
 		 324 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  44.64 
 
 		 248 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  36.23 
 
 		 280 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  44.64 
 
 		 248 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1093  hypothetical protein  28.18 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2463  hypothetical protein  32.84 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.495318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 277 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  31.48 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  41.18 
 
 		 266 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 287 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  32.2 
 
 		 511 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 199 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>