20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3500 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3500  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  831    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496991  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3869  hypothetical protein  39.24 
 
 		 874 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  28.35 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 454 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 448 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 448 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 448 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 454 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 454 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 454 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  29.13 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  29.13 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  29.91 
 
 		 568 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  26.53 
 
 		 591 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  29.92 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1324  hypothetical protein  25.95 
 
 		 231 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.311232  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  27.56 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  26.77 
 
 		 453 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  29.29 
 
 		 484 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  26.43 
 
 		 548 aa  43.1  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>