34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2986 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2986  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  510  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102363  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3205  hypothetical protein  64.11 
 
 
267 aa  326  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0027  hypothetical protein  65.94 
 
 
259 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2944  hypothetical protein  64.4 
 
 
261 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3007  protein of unknown function DUF1037  65.13 
 
 
261 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0308  hypothetical protein  64.32 
 
 
269 aa  314  7e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3258  protein of unknown function DUF1037  65.13 
 
 
261 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.955275  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5495  protein of unknown function DUF1037  64.29 
 
 
261 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0242413 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3808  hypothetical protein  65.13 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2950  protein of unknown function DUF1037  62.86 
 
 
249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0127  hypothetical protein  64.29 
 
 
253 aa  305  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0143  hypothetical protein  63.49 
 
 
261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3349  protein of unknown function DUF1037  64.86 
 
 
236 aa  302  3.0000000000000004e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4342  hypothetical protein  63.87 
 
 
269 aa  302  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  decreased coverage  0.000860336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1236  protein of unknown function DUF1037  60.67 
 
 
239 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4438  hypothetical protein  61.69 
 
 
261 aa  300  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319512  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5571  trehalose utilization-related protein  61.69 
 
 
261 aa  299  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2202  protein of unknown function DUF1037  60.5 
 
 
240 aa  291  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.468062  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1570  protein of unknown function DUF1037  62.67 
 
 
240 aa  291  7e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2966  protein of unknown function DUF1037  58.26 
 
 
248 aa  288  6e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1145  protein of unknown function DUF1037  60.44 
 
 
265 aa  286  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2327  protein of unknown function DUF1037  58.62 
 
 
237 aa  281  7.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.74481  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3468  hypothetical protein  58.56 
 
 
257 aa  275  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17810  trehalose utilization protein  56.54 
 
 
266 aa  274  8e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3683  hypothetical protein  57.14 
 
 
249 aa  272  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0388  protein of unknown function DUF1037  58.26 
 
 
260 aa  271  8.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22301  decreased coverage  0.00488955 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1353  protein of unknown function DUF1037  64.71 
 
 
247 aa  270  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4439  protein of unknown function DUF1037  55.65 
 
 
240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0057675  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1858  protein of unknown function DUF1037  56.05 
 
 
242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3775  protein of unknown function DUF1037  53.98 
 
 
249 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27080  trehalose utilization protein  56.19 
 
 
261 aa  263  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1631  hypothetical protein  43.44 
 
 
233 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  23.55 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  34.44 
 
 
232 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>