18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0185 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0185  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  460  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0006  hypothetical protein  43.61 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1217  hypothetical protein  42.61 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04748  hypothetical protein  41.13 
 
 		 231 aa  191  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0333  hypothetical protein  43.3 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  41.92 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3141  hypothetical protein  41.41 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.129384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2727  hypothetical protein  40.97 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2500  hypothetical protein  40.97 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.774455  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01333  Dihydroorotate dehydrogenase 2  41.15 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  39.11 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0782  hypothetical protein  43.53 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0872  hypothetical protein  41.99 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2299  permease of the major facilitator superfamily  41.63 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0685  hypothetical protein  40.77 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0453  hypothetical protein  31.37 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0273  hypothetical protein  28.04 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>