39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4386 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  100 
 
 
150 aa  317  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  91.33 
 
 
150 aa  297  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  90.67 
 
 
150 aa  297  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  90.67 
 
 
150 aa  295  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  78 
 
 
150 aa  265  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  74 
 
 
173 aa  250  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  77.33 
 
 
150 aa  240  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  65.33 
 
 
150 aa  226  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  66.67 
 
 
150 aa  224  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  62 
 
 
150 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  58 
 
 
150 aa  206  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  60.67 
 
 
150 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  60.67 
 
 
147 aa  202  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  60 
 
 
150 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  56 
 
 
148 aa  176  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  54.67 
 
 
149 aa  175  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  53.33 
 
 
146 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  53.33 
 
 
146 aa  173  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  54 
 
 
146 aa  171  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  54.11 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  48.67 
 
 
141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  54 
 
 
141 aa  148  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  48.67 
 
 
148 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  48.34 
 
 
142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  41.1 
 
 
277 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  35.21 
 
 
272 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  38.28 
 
 
290 aa  94.4  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  38.28 
 
 
290 aa  94.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  34.01 
 
 
238 aa  84  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  33.11 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  33.33 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  32.17 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  33.98 
 
 
228 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  22.22 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 
311 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  34.41 
 
 
291 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  34.41 
 
 
291 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  25.44 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  33.01 
 
 
394 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>