39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0981 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  192  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2935  hypothetical protein  63.93 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3725  hypothetical protein  53.12 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  45.78 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2659  hypothetical protein  50.67 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1551  hypothetical protein  55 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  45.21 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  40.51 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3185  hypothetical protein  60.87 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0152518  normal  0.782596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3243  hypothetical protein  45.83 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2451  hypothetical protein  56 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  42.42 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  55.32 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2740  hypothetical protein  38.27 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.663761  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  41.27 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4291  hypothetical protein  59.52 
 
 		 78 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2785  hypothetical protein  39.13 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  38.46 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0052  hypothetical protein  52.17 
 
 		 80 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0176443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2482  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  44.83 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  39.47 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  33.8 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0602  hypothetical protein  37.29 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2441  hypothetical protein  36.84 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  38.57 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  52.17 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3864  hypothetical protein  46.81 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0283748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1745  hypothetical protein  35.14 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.511357  normal  0.0185902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3790  hypothetical protein  43.64 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.22365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3482  hypothetical protein  43.64 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  35.21 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3599  hypothetical protein  29.51 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.779608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6758  hypothetical protein  38.98 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2522  hypothetical protein  43.64 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1716  hypothetical protein  40.68 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2686  hypothetical protein  36.21 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2965  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>