22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0689 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0689  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  43.28 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  49.06 
 
 
307 aa  55.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 
123 aa  52  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  37.7 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  34.18 
 
 
142 aa  48.5  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  47.92 
 
 
235 aa  46.2  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.75 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  38.33 
 
 
267 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 
216 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  32.14 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.27 
 
 
327 aa  43.5  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0920  spore coat assembly protein SafA  37.78 
 
 
538 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  25.9 
 
 
205 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  39.22 
 
 
335 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1285  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.14 
 
 
376 aa  41.6  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 
289 aa  41.2  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 
333 aa  41.2  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  35.56 
 
 
432 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  40.38 
 
 
175 aa  40.8  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>