24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0661 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0661  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  545  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  32.58 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  32.58 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  29.82 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1746  integral membrane protein  29.33 
 
 		 452 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415451  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  30.64 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  29.49 
 
 		 325 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  32.47 
 
 		 335 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  29.58 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  25 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  31.06 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3259  hypothetical protein  28.27 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  29.39 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  24.47 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13380  predicted integral membrane protein  27.89 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271933  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  23.24 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0158  hypothetical protein  30.81 
 
 		 189 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  20.76 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  28.99 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3440  hypothetical protein  29.84 
 
 		 190 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.744208  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  22.97 
 
 		 228 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  25.95 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  43.86 
 
 		 1821 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>