31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2392 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2392  PepSY-associated TM helix  100 
 
 
258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.932712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2345  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.8 
 
 
248 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.0903937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7103  PepSY-associated TM helix domain protein  40.29 
 
 
240 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4478  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.27 
 
 
239 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0220  hypothetical protein  39.51 
 
 
240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0228  hypothetical protein  43.58 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.165958  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5003  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.23 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.862813  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0422  PepSY-associated TM helix family protein  43.02 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3287  hypothetical protein  43.02 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3394  hypothetical protein  43.02 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0240  hypothetical protein  43.02 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2952  hypothetical protein  43.02 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.442146  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2136  hypothetical protein  43.02 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0206  PepSY-associated TM helix family protein  42.46 
 
 
248 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6407  hypothetical protein  39.9 
 
 
244 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2969  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.46 
 
 
244 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137689  normal  0.135359 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3576  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  41.46 
 
 
233 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.548586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3055  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.02 
 
 
251 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3103  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.46 
 
 
231 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4358  hypothetical protein  40.68 
 
 
246 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2444  PepSY-associated TM helix  40.78 
 
 
231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3058  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.78 
 
 
244 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3077  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.22 
 
 
244 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3067  hypothetical protein  40.1 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.387636 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2998  PepSY-associated TM helix domain protein  38.07 
 
 
254 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3345  PepSY-associated TM helix domain protein  37.56 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2661  hypothetical protein  28.93 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.522386  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  24.35 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.33 
 
 
212 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  23.96 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  22.07 
 
 
223 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>