14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1325 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1325  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  986    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000125315 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  44.94 
 
 		 852 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  44.95 
 
 		 2848 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  47.13 
 
 		 1480 aa  53.9  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  35.71 
 
 		 823 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3626  hypothetical protein  48 
 
 		 576 aa  50.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00173227  normal  0.0443221 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  47.37 
 
 		 1935 aa  47.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  53.03 
 
 		 1362 aa  47  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6058  hypothetical protein  48.08 
 
 		 353 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  48.78 
 
 		 683 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  48.78 
 
 		 683 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  34.55 
 
 		 3861 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  30.37 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  42.19 
 
 		 1908 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>