More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3879 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3879  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
406 aa  825    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2326  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.18 
 
 
398 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3415  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.55 
 
 
414 aa  292  9e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65820  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.19 
 
 
386 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5712  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.94 
 
 
386 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2181  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.44 
 
 
386 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326272  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2038  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.44 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3725  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.19 
 
 
386 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2796  butyryl-CoA dehydrogenase  36.27 
 
 
399 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.262809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.1 
 
 
383 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.76 
 
 
383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1999  acyl-CoA dehydrogenase  37.82 
 
 
391 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0248728  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3822  acyl-CoA dehydrogenase-like  36.07 
 
 
386 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.02 
 
 
386 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1569  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.06 
 
 
389 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881248  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1118  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.04 
 
 
391 aa  209  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4154  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  34.7 
 
 
410 aa  209  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328631  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4410  acyl-CoA dehydrogenase  35.22 
 
 
410 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000319161  normal  0.518491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33210  acyl-CoA dehydrogenase  37.5 
 
 
389 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243663  normal  0.754036 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6429  Butyryl-CoA dehydrogenase  36.59 
 
 
386 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.121067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  34.16 
 
 
392 aa  202  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.58 
 
 
385 aa  201  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2494  Butyryl-CoA dehydrogenase  35.62 
 
 
392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0410  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.55 
 
 
389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.28 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.01 
 
 
388 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34 
 
 
384 aa  195  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.17 
 
 
388 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.33 
 
 
389 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2901  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.67 
 
 
379 aa  193  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.99 
 
 
386 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4494  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.84 
 
 
386 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  35.61 
 
 
384 aa  190  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.17 
 
 
381 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  35.61 
 
 
384 aa  190  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.67 
 
 
381 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.27 
 
 
384 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1850  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.85 
 
 
397 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.5 
 
 
376 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  33.5 
 
 
379 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.34 
 
 
379 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.4 
 
 
396 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  32.75 
 
 
376 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.08 
 
 
388 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  32.75 
 
 
376 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  32.75 
 
 
376 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  32.75 
 
 
376 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2599  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  32.82 
 
 
382 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.279843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0503  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.67 
 
 
379 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  33.5 
 
 
379 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.41 
 
 
387 aa  186  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.496704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.51 
 
 
386 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  32.75 
 
 
376 aa  186  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  32.75 
 
 
381 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.92 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4023  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.91 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5941  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.12 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  32.75 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0441  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.31 
 
 
401 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2039  acyl-CoA dehydrogenase, putative  33 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  33.75 
 
 
379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.42 
 
 
385 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0411302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  32.24 
 
 
381 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2701  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.49 
 
 
386 aa  182  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.47386  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  33.5 
 
 
379 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  32.24 
 
 
381 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3703  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.75 
 
 
388 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000394656  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  33.5 
 
 
379 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0362  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.16 
 
 
406 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1327  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.05 
 
 
399 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3157  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.9 
 
 
387 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.24 
 
 
376 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.67 
 
 
377 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  33.5 
 
 
379 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.25 
 
 
379 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4249  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.81 
 
 
580 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.808927  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2484  Acyl-CoA dehydrogenase  35.4 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  33.5 
 
 
379 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  33.25 
 
 
379 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  33.5 
 
 
379 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3010  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  37.39 
 
 
387 aa  180  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.65 
 
 
407 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.053028  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.81 
 
 
580 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5133  acyl-CoA dehydrogenase  33.83 
 
 
391 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0876  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.39 
 
 
387 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.189497  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3889  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.24 
 
 
395 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0927975  normal  0.409924 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.74 
 
 
379 aa  179  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4277  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.73 
 
 
579 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.943677  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3744  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.79 
 
 
404 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3817  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.79 
 
 
404 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.420794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3756  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.79 
 
 
404 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  33.59 
 
 
400 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4118  Acyl-CoA dehydrogenase  35.54 
 
 
580 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3165  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.48 
 
 
445 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.15 
 
 
389 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  29.97 
 
 
379 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.83 
 
 
380 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0298  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.44 
 
 
381 aa  176  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.4 
 
 
377 aa  176  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.76 
 
 
382 aa  176  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>