24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2666 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
105 aa  196  9e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0696  branched-chain amino acid transport  72.12 
 
 
104 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  55.56 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0574  branched-chain amino acid transport  57 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  35.53 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0775  hypothetical protein  38.16 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0725  hypothetical protein  38.16 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1319  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 
105 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1825  branched chain amino acid ABC transporter  42 
 
 
105 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  32.26 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2223  branched-chain amino acid transport  34.48 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.877315  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2894  branched-chain amino acid transport  38.03 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24933e-22 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5231  branched-chain amino acid transport  32.26 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120117  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  31.75 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1764  branched-chain amino acid transport  29.29 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240182  normal  0.0440928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4738  branched-chain amino acid transport  40 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1388  branched-chain amino acid transport  36.62 
 
 
103 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000854559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2853  hypothetical protein  38.71 
 
 
102 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000052  putative transmembrane protein  30.56 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.323073  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4139  branched-chain amino acid transport  38 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>