More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4594 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007961  Nham_4594  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  872    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  69.93 
 
 
439 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  64.84 
 
 
443 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  64.6 
 
 
443 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  63.7 
 
 
442 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  60.42 
 
 
440 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  57.53 
 
 
443 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4162  protein of unknown function DUF21  60.42 
 
 
440 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3911  protein of unknown function DUF21  57.93 
 
 
418 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7616  protein of unknown function DUF21  57.45 
 
 
418 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2174  protein of unknown function DUF21  58.06 
 
 
404 aa  455  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2493  protein of unknown function DUF21  57.71 
 
 
404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1590  hemolysins and related proteins  53.23 
 
 
436 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.727705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2217  CBS domain-containing protein  57.02 
 
 
365 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  35.53 
 
 
442 aa  285  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  39.1 
 
 
446 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  36.88 
 
 
446 aa  265  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  37.59 
 
 
437 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  37.67 
 
 
431 aa  256  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  36.23 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.86 
 
 
447 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  34.2 
 
 
434 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  36.54 
 
 
433 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  34.76 
 
 
455 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  32.72 
 
 
446 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  35.05 
 
 
428 aa  246  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  35.39 
 
 
438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  35.94 
 
 
437 aa  240  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  36.15 
 
 
443 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  35.82 
 
 
439 aa  239  8e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.67 
 
 
442 aa  239  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  37.04 
 
 
436 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  34.73 
 
 
439 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  33.18 
 
 
435 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  34.64 
 
 
432 aa  237  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  33.41 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  33.41 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  32.95 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  33.41 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  33.41 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  33.18 
 
 
435 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  33.18 
 
 
435 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  32.15 
 
 
443 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  32.15 
 
 
443 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  32.95 
 
 
458 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.41 
 
 
442 aa  231  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  31.24 
 
 
448 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  34.67 
 
 
437 aa  230  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  35.34 
 
 
446 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  32.95 
 
 
446 aa  229  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  33.97 
 
 
435 aa  229  8e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  32.87 
 
 
446 aa  229  9e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  34.43 
 
 
435 aa  227  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  35.17 
 
 
431 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  33.41 
 
 
435 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  32.63 
 
 
428 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  31.59 
 
 
442 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  33.72 
 
 
443 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  32.87 
 
 
439 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  30.88 
 
 
454 aa  223  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  34.1 
 
 
439 aa  222  9e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  34.52 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  34.1 
 
 
439 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  32.37 
 
 
430 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  30.14 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  34.27 
 
 
466 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  31.09 
 
 
440 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  31.15 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  31.65 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  32.7 
 
 
435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  31.36 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  33.72 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  31.26 
 
 
451 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  31.26 
 
 
451 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  31.26 
 
 
451 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  32.39 
 
 
444 aa  220  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  31.76 
 
 
443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  33.73 
 
 
432 aa  220  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  30.96 
 
 
442 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  30.96 
 
 
442 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  30.96 
 
 
442 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  31.53 
 
 
443 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  30.96 
 
 
442 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.96 
 
 
442 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  30.96 
 
 
442 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  33.41 
 
 
456 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  33.72 
 
 
431 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  30.96 
 
 
442 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  30.84 
 
 
449 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0151  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.49 
 
 
433 aa  219  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  30.73 
 
 
442 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  31.76 
 
 
443 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  30.7 
 
 
437 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  31.25 
 
 
445 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  32 
 
 
443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  31.03 
 
 
451 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  32.95 
 
 
443 aa  217  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  31.06 
 
 
440 aa  217  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0022  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.03 
 
 
442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  34.05 
 
 
464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>