More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5402 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  100 
 
 		 107 aa  217  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  70.19 
 
 		 108 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  68.57 
 
 		 108 aa  161  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  66.35 
 
 		 108 aa  155  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  65.71 
 
 		 109 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  63.81 
 
 		 116 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  65.71 
 
 		 109 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  65.71 
 
 		 109 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  63.81 
 
 		 109 aa  150  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  62.5 
 
 		 110 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  60.95 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  60.95 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  63.73 
 
 		 108 aa  141  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  60.95 
 
 		 108 aa  141  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  59.43 
 
 		 108 aa  140  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  63 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  57.55 
 
 		 106 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  60.75 
 
 		 107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  61 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  57.01 
 
 		 107 aa  137  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  62.24 
 
 		 107 aa  137  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  65.31 
 
 		 107 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  57.84 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  57.14 
 
 		 109 aa  133  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  62.38 
 
 		 107 aa  133  8e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  61.39 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  64.52 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  61.22 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  59.6 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  64.52 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  64.52 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  64.52 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  57.94 
 
 		 109 aa  131  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  64.52 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  58.16 
 
 		 107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  54.81 
 
 		 115 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  63.44 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  61.39 
 
 		 107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  59.41 
 
 		 107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  58.16 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  51.96 
 
 		 108 aa  130  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  58.76 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  61.22 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  55.14 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  57.14 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  52.88 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  59.18 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  55.56 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  60.2 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  60.2 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  53.33 
 
 		 107 aa  127  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  50.96 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  55.56 
 
 		 107 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  56.84 
 
 		 107 aa  126  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  57.58 
 
 		 106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  58.76 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  55.14 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  58.33 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  55.1 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  56.7 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  55.1 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  55.79 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  55.79 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  56.25 
 
 		 111 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  56.84 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  55.79 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  51.4 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  55.79 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  55.67 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  123  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  54.9 
 
 		 112 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  56.44 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  58.33 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  58.59 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  54.08 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  52.83 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  58.33 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  58.59 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  52.53 
 
 		 112 aa  123  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  50.94 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  58.24 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  54.72 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  120  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>