21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4619 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4619  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1183    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.275765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3334  hypothetical protein  36.89 
 
 		 302 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1994  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.19 
 
 		 590 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0863  hypothetical protein  30.65 
 
 		 223 aa  88.2  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  24.21 
 
 		 598 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  23.83 
 
 		 598 aa  69.7  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  23.73 
 
 		 606 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  28.57 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  25.09 
 
 		 641 aa  60.5  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  25.47 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  28.36 
 
 		 382 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  27.86 
 
 		 382 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  22.57 
 
 		 513 aa  52.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.39 
 
 		 615 aa  51.2  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  23.2 
 
 		 600 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.66 
 
 		 708 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.43 
 
 		 647 aa  47.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.62 
 
 		 613 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  21.32 
 
 		 586 aa  44.3  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  33.7 
 
 		 653 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  21.02 
 
 		 666 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>