67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2907 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  100 
 
 		 135 aa  270  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  66.41 
 
 		 134 aa  173  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  67.41 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  64.89 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  64.89 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  65.91 
 
 		 133 aa  160  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  67.41 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  61.19 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  60.74 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  60.43 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  61.07 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  69.29 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  59.7 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  68.7 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  57.14 
 
 		 133 aa  145  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  61.02 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  55.88 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  57.58 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  56.82 
 
 		 133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  55.64 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  53.44 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  58.27 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  55.22 
 
 		 132 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  56.15 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  54.14 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  55.73 
 
 		 131 aa  123  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  55.81 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  56.59 
 
 		 141 aa  120  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  55.74 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  37.04 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  33.59 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 270 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  29.9 
 
 		 195 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  31.3 
 
 		 282 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  38.16 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  31.3 
 
 		 282 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 268 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  31.3 
 
 		 282 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  31.3 
 
 		 282 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  31.3 
 
 		 282 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  31.3 
 
 		 262 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  42.86 
 
 		 452 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 290 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  41.07 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  29.57 
 
 		 282 aa  43.9  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  37.5 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  32 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3517  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 380 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  30.43 
 
 		 282 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4319  TOBE domain-containing protein  32.26 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  36.99 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  43.28 
 
 		 374 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  38.81 
 
 		 264 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0054  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.14 
 
 		 361 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0256  TOBE domain-containing protein  32.26 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0359931  normal  0.02055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0241  TOBE domain protein  32.26 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252493  normal  0.0167291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0618  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000430997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  34.38 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  30.86 
 
 		 267 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  36.99 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  32.81 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1774  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  36.99 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  39.68 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  32.84 
 
 		 278 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  32 
 
 		 142 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  37.5 
 
 		 361 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>