19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0955 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0955  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 
236 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  37.56 
 
 
212 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.48 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.33 
 
 
218 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4061  hypothetical protein  29.27 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0644782  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.39 
 
 
747 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1115  hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.48 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5446  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.81 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0785  hypothetical protein  29.87 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1243  hypothetical protein  30.26 
 
 
262 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1048  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.27 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2034  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  36.6 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.568645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3557  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  31.78 
 
 
213 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5355  hypothetical protein  37.38 
 
 
145 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.9 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.41 
 
 
199 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
557 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.95 
 
 
507 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>