184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0551 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  100 
 
 
464 aa  902    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  75.93 
 
 
461 aa  636    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  71.43 
 
 
473 aa  620  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  70.41 
 
 
461 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  70.41 
 
 
461 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  70.41 
 
 
461 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  69.96 
 
 
463 aa  600  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  70.7 
 
 
480 aa  596  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  68.88 
 
 
463 aa  593  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  66.88 
 
 
462 aa  580  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  69.35 
 
 
475 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  71.87 
 
 
459 aa  569  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  65.86 
 
 
469 aa  556  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  62.72 
 
 
475 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  63.99 
 
 
463 aa  551  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  66.52 
 
 
478 aa  549  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  68.09 
 
 
476 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  64.38 
 
 
471 aa  548  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  63.36 
 
 
469 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  62.88 
 
 
465 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  62.55 
 
 
503 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  64.12 
 
 
507 aa  497  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  59.08 
 
 
511 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  60.61 
 
 
477 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  48.26 
 
 
464 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.83 
 
 
505 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.5 
 
 
460 aa  360  2e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  41.95 
 
 
475 aa  359  5e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.74 
 
 
502 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  48.23 
 
 
487 aa  350  3e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  49 
 
 
510 aa  341  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  45.48 
 
 
499 aa  338  9e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  45.65 
 
 
487 aa  330  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  42.76 
 
 
486 aa  322  8e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  46.4 
 
 
497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  46.11 
 
 
510 aa  320  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  45.82 
 
 
512 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  41.01 
 
 
473 aa  309  5.9999999999999995e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  42.05 
 
 
473 aa  309  6.999999999999999e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.98 
 
 
374 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  26.78 
 
 
637 aa  63.5  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  26.78 
 
 
637 aa  63.2  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  28.93 
 
 
334 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  28.93 
 
 
334 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  29.1 
 
 
306 aa  60.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  26.7 
 
 
334 aa  60.5  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.83 
 
 
373 aa  60.1  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.67 
 
 
369 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.05 
 
 
341 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.27 
 
 
357 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.49 
 
 
340 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  28.51 
 
 
334 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.64 
 
 
340 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.73 
 
 
405 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.78 
 
 
340 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  26.17 
 
 
304 aa  57.4  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  27.8 
 
 
334 aa  57.4  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.97 
 
 
358 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.97 
 
 
358 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.73 
 
 
340 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.97 
 
 
341 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.93 
 
 
364 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.64 
 
 
336 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.93 
 
 
337 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.03 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.57 
 
 
306 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.51 
 
 
337 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  26.78 
 
 
689 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2041  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  29.77 
 
 
611 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.637814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.51 
 
 
337 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.98 
 
 
673 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  26.92 
 
 
307 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  26.11 
 
 
303 aa  51.6  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.87 
 
 
368 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.02 
 
 
324 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.78 
 
 
348 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.75 
 
 
362 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  25.96 
 
 
362 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  28.37 
 
 
332 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  30.23 
 
 
683 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  32.78 
 
 
347 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  26.79 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  30.11 
 
 
620 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.25 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.44 
 
 
673 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.26 
 
 
327 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  35.16 
 
 
323 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27460  MoxR-like ATPase  32.06 
 
 
352 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.36 
 
 
671 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  25.53 
 
 
362 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  27.05 
 
 
443 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  25.42 
 
 
512 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.45 
 
 
403 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0145  magnesium chelatase subunit I  26.23 
 
 
339 aa  47.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.77 
 
 
616 aa  47.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.15 
 
 
363 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2044  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.63 
 
 
314 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1156  putative serine protein kinase, PrkA  25.57 
 
 
631 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.84 
 
 
327 aa  47  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  35.44 
 
 
314 aa  46.6  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>