32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5406 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  100 
 
 		 260 aa  484  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  68.7 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  65.73 
 
 		 262 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  65.73 
 
 		 262 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  66.29 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  55.17 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  44.55 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  42.19 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  34.17 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  35.62 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  34.34 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  31.13 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  47.95 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  34.15 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  50 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  40 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  35.42 
 
 		 322 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  25.7 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  24.53 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  27.31 
 
 		 336 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  35.58 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  31.93 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  40.2 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  26.13 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  31.13 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 322 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  35.19 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  27.6 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  23.12 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 321 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 322 aa  42  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  23.73 
 
 		 310 aa  42  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>