More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0437 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
342 aa  668    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.38 
 
 
367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.99 
 
 
325 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2125  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.79 
 
 
343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2177  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.88 
 
 
363 aa  298  6e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5633  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  44.91 
 
 
350 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.89 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.989354  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1851  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  42.17 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.737422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5914  ABC transporter, permease protein  41.14 
 
 
331 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  0.0354831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1822  oligopeptide transport integral membrane protein  40.48 
 
 
341 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.661927  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
344 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
341 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.969826  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
336 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
321 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
349 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.95 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
301 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  31.9 
 
 
299 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3511  oligopeptide ABC transporter (permease)  39.13 
 
 
317 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
303 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.35 
 
 
303 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
303 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  32.49 
 
 
299 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  32.49 
 
 
299 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  32.49 
 
 
299 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.65 
 
 
303 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.65 
 
 
303 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  34.35 
 
 
303 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.65 
 
 
303 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.49 
 
 
299 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.65 
 
 
303 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  38.61 
 
 
304 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  38.61 
 
 
304 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  33.94 
 
 
299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
291 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.532821  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
301 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
299 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24260  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.46 
 
 
313 aa  189  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
299 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 
302 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  35.33 
 
 
302 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 
302 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  38.82 
 
 
288 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 
302 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
299 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 
302 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  35.33 
 
 
302 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 
302 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
304 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
301 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
309 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.05 
 
 
303 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
299 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
297 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
297 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.69 
 
 
301 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1115  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  35.33 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.0461956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
294 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
280 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.28 
 
 
293 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.42 
 
 
317 aa  182  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
318 aa  182  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
301 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  37.54 
 
 
479 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
308 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  34.7 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.14 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.21 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
277 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
300 aa  179  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
278 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
301 aa  179  9e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  35.08 
 
 
300 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
284 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7325  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  35.05 
 
 
300 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.14 
 
 
307 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  40.6 
 
 
300 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
285 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
285 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
300 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
280 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
307 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
468 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  36.27 
 
 
304 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
307 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
301 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.42 
 
 
284 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
281 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0153047  normal  0.258787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>