295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1687 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  100 
 
 		 448 aa  868    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  63 
 
 		 462 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  61.36 
 
 		 450 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  62.76 
 
 		 447 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  61.92 
 
 		 446 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  59.25 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  61.12 
 
 		 446 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  59.81 
 
 		 456 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  61.59 
 
 		 460 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  59.26 
 
 		 456 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  57.28 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  61.12 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  59.67 
 
 		 444 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  54.63 
 
 		 450 aa  465  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  60.05 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  59.15 
 
 		 448 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  57.08 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  57.08 
 
 		 451 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  57.97 
 
 		 460 aa  455  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  58.29 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  58.78 
 
 		 443 aa  455  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  56.61 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  56.85 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  58.41 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  56.44 
 
 		 448 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  55.29 
 
 		 450 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  52.84 
 
 		 426 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  59.34 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  58.87 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  52.36 
 
 		 456 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  50 
 
 		 622 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  52.8 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  51.32 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  52.36 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  49.26 
 
 		 463 aa  385  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53800  manganese transport protein MntH  57.28 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0707822  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  49.64 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  49.52 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  48.82 
 
 		 442 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  52.9 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  49.27 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  47.63 
 
 		 442 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  44.57 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  49.4 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  49.65 
 
 		 625 aa  363  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3226  Mn2+/Fe2+ transporter  46.08 
 
 		 473 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  43.52 
 
 		 450 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  43.52 
 
 		 450 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  50 
 
 		 439 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2499  manganese transport protein MntH  50 
 
 		 410 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.645994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.6 
 
 		 627 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0246  manganese transport protein MntH  44.29 
 
 		 444 aa  350  3e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  45.26 
 
 		 438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0339  manganese transporter NRAMP  44.27 
 
 		 464 aa  343  5e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00143426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  45.83 
 
 		 437 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  45.83 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  45.83 
 
 		 437 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  45.83 
 
 		 437 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  45.83 
 
 		 437 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  44.94 
 
 		 438 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  44.94 
 
 		 438 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  44.94 
 
 		 438 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  44.68 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1949  Mn2+/Fe2+ transporter  46.7 
 
 		 448 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344744  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1280  Mn2+/Fe2+ transporter  47.68 
 
 		 448 aa  329  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.547959 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2311  manganese transport protein  50.13 
 
 		 435 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  46.45 
 
 		 438 aa  329  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1789  Mn2+/Fe2+ transporter  49.87 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0106  Mn2+/Fe2+ transporter  49.87 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2124  manganese/iron transporter  49.87 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2180  manganese/iron transporter  49.6 
 
 		 435 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122335  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  42.11 
 
 		 444 aa  323  3e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  45.19 
 
 		 452 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2310  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.38 
 
 		 433 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  45.04 
 
 		 391 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  42.79 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  45.68 
 
 		 420 aa  310  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1555  Mn2+/Fe2+ transporter  41.24 
 
 		 434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000268932  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2275  manganese/iron transporter  49.47 
 
 		 520 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626373  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D30  manganese transporter NRAMP  39.81 
 
 		 525 aa  302  1e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000755311  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  43.8 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0311  Mn2+/Fe2+ transporter  41.82 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  42.2 
 
 		 442 aa  296  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  41.51 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.65 
 
 		 430 aa  295  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2025  Mn2+/Fe2+ transporter  39.16 
 
 		 522 aa  292  7e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1183  manganese transporter NRAMP  39.9 
 
 		 473 aa  291  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  42.05 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  39.06 
 
 		 432 aa  285  9e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  41.23 
 
 		 412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  41.94 
 
 		 434 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  40.14 
 
 		 413 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  40.38 
 
 		 412 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  40.38 
 
 		 412 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  39.16 
 
 		 431 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  40.38 
 
 		 412 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  40.38 
 
 		 412 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  40.38 
 
 		 412 aa  283  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  40.38 
 
 		 412 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  40.28 
 
 		 431 aa  283  6.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>