26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1401 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1401  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 86 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.489676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  46.25 
 
 		 83 aa  62  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  43.21 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  50.82 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  48.44 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  35.29 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  36.99 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  37.68 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  35.8 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  41.79 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  43.9 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  40.24 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  42.17 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  36.59 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  39.76 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  40.23 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  50 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  41.79 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  38.27 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3961  prevent-host-death family protein  40.91 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.986483  normal  0.184191 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  43.4 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>