More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2131 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  60.84 
 
 		 574 aa  696    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 566 aa  1157    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 570 aa  513  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 		 570 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 570 aa  504  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 570 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 569 aa  491  1e-137  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 588 aa  433  1e-120  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 564 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 571 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 555 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 555 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 555 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 561 aa  362  9e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 557 aa  356  6.999999999999999e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 561 aa  355  1e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 569 aa  355  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 		 555 aa  353  5e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 561 aa  350  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 634 aa  347  5e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 560 aa  342  9e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 562 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 573 aa  302  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 		 582 aa  297  4e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 		 590 aa  289  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 579 aa  283  7.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 799 aa  216  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 		 568 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 		 570 aa  203  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 555 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 		 555 aa  200  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 555 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 555 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 555 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 555 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 555 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  31.81 
 
 		 548 aa  194  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 554 aa  194  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 554 aa  192  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1300  glutaminyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 794 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.91877 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 569 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  32.26 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 552 aa  192  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 551 aa  190  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 		 553 aa  189  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 580 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89978  glutamine-tRNA ligase  29.57 
 
 		 720 aa  188  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.220095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 551 aa  188  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 561 aa  188  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 555 aa  187  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 555 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 555 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 552 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1755  glutaminyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 		 802 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 568 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  32.11 
 
 		 858 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 		 540 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 556 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 552 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 563 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 552 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2188  glutaminyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 816 aa  183  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00249648  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0094  glutaminyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 556 aa  183  7e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 554 aa  183  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 565 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 565 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 565 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 565 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 556 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 556 aa  181  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 579 aa  180  8e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.450969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 556 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 556 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  31.39 
 
 		 570 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 558 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39738  predicted protein  28.03 
 
 		 749 aa  177  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 559 aa  177  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 556 aa  177  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 565 aa  176  7e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 556 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0665  glutaminyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 579 aa  176  8e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0340381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03410  glutaminyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 555 aa  176  8e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 566 aa  176  9e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 572 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>