35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0972 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0972  major facilitator transporter  100 
 
 		 387 aa  750    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.408087 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2763  major facilitator superfamily MFS_1  59.83 
 
 		 374 aa  432  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640372  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0859  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 430 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2076  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284167  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1347  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.258837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  20.75 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 443 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 473 aa  46.2  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2162  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.07 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 478 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  27.74 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3400  major facilitator superfamily MFS_1  22.62 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  28.83 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  25.81 
 
 		 436 aa  43.5  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 419 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 449 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  24.54 
 
 		 441 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>