More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2426 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2426  periplasmic binding protein  100 
 
 		 311 aa  629  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2424  periplasmic binding protein  29.63 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3083  periplasmic binding protein  33.47 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3038  periplasmic binding protein  33.86 
 
 		 365 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1370  periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0381194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.52 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.52 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  29.52 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.04 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.15 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2753  periplasmic binding protein  28 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  30.71 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.71 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  27.41 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  28.19 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  30.29 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.37 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  30.19 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.37 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  28.68 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  29.21 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  29.58 
 
 		 351 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  29.95 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  30.19 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  30.19 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  30.66 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  30.19 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  30.19 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  29.29 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  29.21 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  31.34 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.46 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.88 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.88 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.88 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.24 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  28.05 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  26.62 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.05 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  34.78 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  37.34 
 
 		 662 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  27.49 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  22.66 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  32.43 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.05 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  30.56 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  31.28 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  33.12 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.12 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.12 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  33.12 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  33.12 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  33.12 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  29.52 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  28.71 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  32.47 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  32.47 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  32.47 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  29.32 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  37.58 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  28.34 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  31.28 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  27.8 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.3 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  26.6 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  32.47 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  26.83 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2591  ferric siderophore ABC transporter, periplasmic siderophore-binding protein  27.46 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619611  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  29.09 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06298  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  28.16 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  29.22 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  30.85 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  27.95 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.75 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.7 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  29.54 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  30.29 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  25.52 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  33.88 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  29.75 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  26.56 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  33.58 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  26.46 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  26.77 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  30.53 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  30.52 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.43 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  32.46 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  29.02 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  25.3 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  23.89 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>