More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1175 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1175  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 126 aa  232  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000154127  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2675  ribosomal protein L7/L12  88.1 
 
 		 126 aa  177  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000113086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0639  50S ribosomal protein L7/L12  71.43 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.500427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  63.79 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  72.58 
 
 		 125 aa  120  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  65 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  68 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0338  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1700  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0352  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0746  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00478946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0567  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  69.35 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2543  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 		 126 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  59.82 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 		 127 aa  106  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  65.04 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 		 123 aa  104  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  61.21 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  59.83 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0233  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  61.21 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1323  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  55.17 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  60.36 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1421  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927716  normal  0.299454 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  62.93 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  55.93 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  56.64 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  60.68 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  63.79 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  60.87 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  60.87 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  66.07 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 125 aa  97.1  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  52.99 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  52.99 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  61.21 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0527  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.359343  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  57.81 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0508  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000524403  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2197  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000379347  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  61.02 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  62.3 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2107  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  56.9 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  52.59 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1457  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000553031  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  65.6 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  52.59 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  63.39 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>