23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0600 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  236  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0532  hypothetical protein  54.31 
 
 
117 aa  138  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.330489  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3520  hypothetical protein  80.6 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363684 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  45.69 
 
 
117 aa  110  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1368  hypothetical protein  44.83 
 
 
117 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4512  hypothetical protein  39.66 
 
 
117 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.90814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5087  hypothetical protein  39.64 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115983  normal  0.14262 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0820  hypothetical protein  42.39 
 
 
110 aa  77  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0617234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  38.75 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  35 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  22.92 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  42.37 
 
 
122 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  29.81 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1053  hypothetical protein  36.92 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0170  hypothetical protein  34.07 
 
 
130 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  45 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  35.29 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0056  hypothetical protein  25 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2196  hypothetical protein  28.43 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  37.25 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4618  hypothetical protein  24.76 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  35.59 
 
 
124 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>