More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3845 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  100 
 
 
177 aa  360  6e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  95.45 
 
 
177 aa  346  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  95.45 
 
 
177 aa  346  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  95.45 
 
 
177 aa  346  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  92.05 
 
 
177 aa  335  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  92.05 
 
 
177 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  84.09 
 
 
176 aa  311  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  82.39 
 
 
176 aa  307  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  80.11 
 
 
176 aa  296  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  79.55 
 
 
176 aa  293  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  77.84 
 
 
176 aa  288  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  78.98 
 
 
176 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  78.41 
 
 
176 aa  289  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  79.55 
 
 
176 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  77.84 
 
 
176 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  78.98 
 
 
176 aa  287  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  77.84 
 
 
176 aa  287  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  78.41 
 
 
176 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  77.27 
 
 
176 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  77.84 
 
 
176 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  77.01 
 
 
185 aa  279  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  76.44 
 
 
174 aa  271  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  69.32 
 
 
176 aa  264  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  68.18 
 
 
176 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  70.45 
 
 
175 aa  260  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  69.71 
 
 
185 aa  259  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  69.89 
 
 
175 aa  259  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  69.89 
 
 
175 aa  259  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  69.32 
 
 
176 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  65.91 
 
 
177 aa  251  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  61.93 
 
 
176 aa  238  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  59.09 
 
 
176 aa  230  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  54.8 
 
 
177 aa  220  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  55.93 
 
 
177 aa  220  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  57.63 
 
 
177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  57.63 
 
 
177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 
177 aa  218  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  54.24 
 
 
177 aa  218  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  57.39 
 
 
177 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  56.9 
 
 
182 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  61.93 
 
 
179 aa  215  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  54.24 
 
 
177 aa  216  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  55.93 
 
 
177 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 
177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 
185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 
177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 
185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 
185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  53.11 
 
 
177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 
185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 
185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 
185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 
177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 
177 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  53.71 
 
 
185 aa  214  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  54.29 
 
 
185 aa  214  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  53.71 
 
 
185 aa  214  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  53.71 
 
 
185 aa  214  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  54.29 
 
 
185 aa  214  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  53.71 
 
 
185 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  54.29 
 
 
185 aa  214  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  53.71 
 
 
185 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  53.71 
 
 
185 aa  214  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  53.71 
 
 
185 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  54.29 
 
 
185 aa  214  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  54.02 
 
 
194 aa  214  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 
185 aa  214  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  52.87 
 
 
194 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  52.87 
 
 
194 aa  214  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  53.45 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  55.75 
 
 
182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  60.57 
 
 
178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  54.35 
 
 
186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000594191  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  53.11 
 
 
177 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 
177 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 
177 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  53.18 
 
 
190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  54.8 
 
 
177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  55.11 
 
 
177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  52.54 
 
 
177 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  52.54 
 
 
177 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  55.11 
 
 
177 aa  210  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  55.37 
 
 
177 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  55.17 
 
 
182 aa  210  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  55.43 
 
 
181 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  52.87 
 
 
193 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  55.43 
 
 
181 aa  209  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  55.43 
 
 
181 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  54.86 
 
 
181 aa  208  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  54.86 
 
 
181 aa  208  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  52.87 
 
 
193 aa  208  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  54.86 
 
 
181 aa  208  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  54.86 
 
 
181 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  54.86 
 
 
181 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  54.86 
 
 
181 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  54.86 
 
 
181 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  54.86 
 
 
181 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4288  NusG antitermination factor  54.24 
 
 
177 aa  207  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000127222  hitchhiker  0.00000238714 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  54.29 
 
 
181 aa  206  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  54.29 
 
 
181 aa  206  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>