79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1346 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  681    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  58.4 
 
 
357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  49.19 
 
 
380 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  46.73 
 
 
366 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  53.59 
 
 
343 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  55.56 
 
 
349 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  47.76 
 
 
344 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  51.41 
 
 
364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  47.24 
 
 
366 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  44.48 
 
 
352 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  54.37 
 
 
400 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  42.09 
 
 
337 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  39.81 
 
 
338 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  45.38 
 
 
336 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  39.48 
 
 
338 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  42.25 
 
 
337 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  39.48 
 
 
338 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  47.03 
 
 
338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  44.54 
 
 
338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  38.41 
 
 
339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  47.03 
 
 
338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  39.94 
 
 
337 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  46.82 
 
 
337 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  43.75 
 
 
328 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  50 
 
 
205 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  43.38 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  47.52 
 
 
341 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  47.15 
 
 
316 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  37.23 
 
 
354 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  44.09 
 
 
315 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  43.18 
 
 
315 aa  185  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  45.6 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  45.6 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  45.6 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  43.81 
 
 
357 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  43.78 
 
 
315 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  38.79 
 
 
274 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  45.18 
 
 
443 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  38.65 
 
 
303 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  41.84 
 
 
443 aa  165  9e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  40.71 
 
 
503 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  36.89 
 
 
925 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1596  hypothetical protein  36.86 
 
 
338 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91747  hitchhiker  0.00122514 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1162  hypothetical protein  38.43 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1642  hypothetical protein  38.43 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118312  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4788  hypothetical protein  37.99 
 
 
344 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173815  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1539  hypothetical protein  36.22 
 
 
341 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1560  hypothetical protein  36.22 
 
 
341 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0159357  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1617  hypothetical protein  37.99 
 
 
343 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00170035 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  32.16 
 
 
222 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1943  hypothetical protein  33.9 
 
 
199 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  31.72 
 
 
195 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4324  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  31.82 
 
 
205 aa  84  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  25.56 
 
 
192 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
194 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00758  conserved hypothetical protein  24.83 
 
 
496 aa  77.8  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  30.07 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  26.32 
 
 
813 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  30.94 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  25.54 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  26.32 
 
 
224 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  26.32 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  26.32 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  29.27 
 
 
207 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  30.27 
 
 
187 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  21.74 
 
 
810 aa  59.3  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  30.43 
 
 
187 aa  59.3  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  25.41 
 
 
447 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  31.52 
 
 
842 aa  57  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  26.32 
 
 
184 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  26.32 
 
 
191 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  23.53 
 
 
818 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  27.72 
 
 
189 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  26.92 
 
 
203 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0198  IucA/IucC family protein  29.94 
 
 
209 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0130557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  28.33 
 
 
196 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  26.04 
 
 
188 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  29.63 
 
 
209 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  26.11 
 
 
188 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.432912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>