270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4548 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4434  hypothetical protein  94.06 
 
 
387 aa  718    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4548  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  788    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4067  hypothetical protein  93.54 
 
 
387 aa  714    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4720  hypothetical protein  54.85 
 
 
366 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2278  hypothetical protein  47.16 
 
 
355 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5780  hypothetical protein  50.45 
 
 
361 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4182  hypothetical protein  46.08 
 
 
358 aa  315  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221061  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2638  hypothetical protein  46.51 
 
 
356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12684  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6236  hypothetical protein  45.4 
 
 
363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0379  hypothetical protein  43.92 
 
 
359 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3724  hypothetical protein  45.4 
 
 
355 aa  298  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.994214  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0430  hypothetical protein  45.09 
 
 
359 aa  292  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3561  hypothetical protein  41.1 
 
 
388 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1300  hypothetical protein  31.51 
 
 
348 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0180  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
831 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4711  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 
338 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0050  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
380 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3918  homoserine O-acetyltransferase  34.24 
 
 
345 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3432  hypothetical protein  29.62 
 
 
340 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4873  homoserine O-acetyltransferase  24.86 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4562  homoserine O-acetyltransferase  25.75 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4498  homoserine O-acetyltransferase  25.68 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202595  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2096  homoserine O-acetyltransferase  31.61 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2478  hypothetical protein  33.17 
 
 
345 aa  93.2  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0540594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3584  homoserine O-acetyltransferase  29.19 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382876  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4867  homoserine O-acetyltransferase  24.59 
 
 
374 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0051  homoserine O-acetyltransferase  32.41 
 
 
386 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0393  homoserine O-acetyltransferase  25.27 
 
 
374 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244956  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3407  homoserine O-acetyltransferase  26.29 
 
 
373 aa  90.9  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  25.13 
 
 
488 aa  90.1  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14330  homoserine O-acetyltransferase  28.66 
 
 
405 aa  89.7  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1125  homoserine O-acetyltransferase  23.89 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000197892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4843  homoserine O-acetyltransferase  25 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00942637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2859  homoserine O-acetyltransferase  36.73 
 
 
364 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4849  homoserine O-acetyltransferase  23.72 
 
 
374 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0896  hypothetical protein  26.86 
 
 
350 aa  87.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.039913  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4076  homoserine O-acetyltransferase  33.65 
 
 
359 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.66182  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3500  homoserine O-acetyltransferase  26.51 
 
 
371 aa  86.7  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000120242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4629  homoserine O-acetyltransferase  23.91 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.533677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2822  homoserine O-acetyltransferase  33.02 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4983  homoserine O-acetyltransferase  23.91 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3134  homoserine O-acetyltransferase  26.79 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289102  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0338  homoserine O-acetyltransferase  26.73 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0437  homoserine O-acetyltransferase  26.88 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2462  homoserine O-acetyltransferase  27.42 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  25.69 
 
 
496 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4254  homoserine O-acetyltransferase  27.75 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.218969  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1589  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.643722  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0385  homoserine O-acetyltransferase  36.36 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.859111  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7515  hypothetical protein  30.56 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3190  homoserine O-acetyltransferase  26.35 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4482  homoserine O-acetyltransferase  23.64 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0752  homoserine O-acetyltransferase  27.27 
 
 
391 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00772131  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0611  hypothetical protein  28.96 
 
 
347 aa  84  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0231125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4332  homoserine O-acetyltransferase  26.45 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  26.1 
 
 
487 aa  83.2  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  25.63 
 
 
492 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2039  homoserine O-acetyltransferase  28.08 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0765159  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2886  homoserine O-acetyltransferase  27.3 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13740  homoserine O-acetyltransferase  28.83 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.316838  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1186  homoserine O-acetyltransferase  26.27 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4432  homoserine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.29031  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3002  homoserine O-acetyltransferase  27.62 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.92469  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  24.66 
 
 
491 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4281  homoserine O-acetyltransferase  25.97 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183607  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1728  homoserine O-acetyltransferase  24.53 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1759  homoserine O-acetyltransferase  29.15 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00875  homoserine acetyltransferase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G15350)  34.19 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.611267 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1824  homoserine O-acetyltransferase  32.81 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5323  homoserine O-acetyltransferase  30 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0329  homoserine O-acetyltransferase  27.17 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115964 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1308  homoserine O-acetyltransferase  31.73 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00994406  normal  0.346812 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2563  homoserine O-acetyltransferase  30.39 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1457  homoserine O-acetyltransferase  28.48 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0283  hypothetical protein  28.71 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99545  normal  0.0139101 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1766  homoserine O-acetyltransferase  31.96 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3266  homoserine O-acetyltransferase  25.58 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3400  homoserine O-acetyltransferase  30.3 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0373  hypothetical protein  25.82 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03040  homoserine O-acetyltransferase  30.05 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0061  homoserine O-acetyltransferase  26.43 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2011  homoserine O-acetyltransferase  23.76 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4463  homoserine O-acetyltransferase  23.37 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0977  homoserine O-acetyltransferase  24.78 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3037  homoserine O-acetyltransferase  31.5 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0609  homoserine O-acetyltransferase  25.63 
 
 
436 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.110749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0061  homoserine O-acetyltransferase  33.16 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1097  homoserine O-acetyltransferase  27.42 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.076735  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0027  homoserine O-acetyltransferase  31.48 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1987  homoserine O-acetyltransferase  32.55 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0873301  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0377  homoserine O-acetyltransferase  31.5 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3644  homoserine O-acetyltransferase  22.68 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2480  homoserine O-acetyltransferase  26.24 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3096  homoserine O-acetyltransferase  31 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.867296  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4099  homoserine O-acetyltransferase  25.53 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3154  homoserine O-acetyltransferase  31 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3723  homoserine O-acetyltransferase  30.3 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3478  homoserine O-acetyltransferase  27.11 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0188606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0969  homoserine O-acetyltransferase  27.46 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0768373  normal  0.579179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0143  homoserine O-acetyltransferase  31 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>