261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0051 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0051  homoserine O-acetyltransferase  100 
 
 
386 aa  797    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0050  alpha/beta hydrolase fold  67.84 
 
 
380 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3432  hypothetical protein  33.63 
 
 
340 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0061  homoserine O-acetyltransferase  30.42 
 
 
338 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1589  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 
337 aa  138  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.643722  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0611  hypothetical protein  29.45 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0231125 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2478  hypothetical protein  30.23 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0540594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1835  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 
353 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0026  hypothetical protein  29.12 
 
 
342 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2369  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
348 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0036  hypothetical protein  29.12 
 
 
342 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0373  hypothetical protein  27.35 
 
 
359 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0045  hypothetical protein  29.12 
 
 
342 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0127659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3376  hypothetical protein  27.49 
 
 
338 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628493  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3685  hypothetical protein  27.49 
 
 
338 aa  122  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0896  hypothetical protein  29.86 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.039913  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3567  hypothetical protein  27.43 
 
 
338 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1089  homoserine O-acetyltransferase  29.74 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.740239  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5507  hypothetical protein  30 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1300  hypothetical protein  29.19 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1470  homoserine O-acetyltransferase  27.81 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0842  homoserine O-acetyltransferase  29.35 
 
 
383 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7515  hypothetical protein  27.81 
 
 
341 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2372  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
345 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0598  hypothetical protein  26.95 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.693744  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3918  homoserine O-acetyltransferase  28.62 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1308  homoserine O-acetyltransferase  28.95 
 
 
374 aa  109  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00994406  normal  0.346812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  36.9 
 
 
496 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5780  hypothetical protein  35.29 
 
 
361 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4252  homoserine O-acetyltransferase  27.25 
 
 
400 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647342  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4711  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
338 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4281  homoserine O-acetyltransferase  26.75 
 
 
400 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183607  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0379  hypothetical protein  32.77 
 
 
359 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5144  hypothetical protein  27.08 
 
 
338 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.565819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1709  homoserine O-acetyltransferase  26.76 
 
 
379 aa  106  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.980413  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1714  hypothetical protein  26.47 
 
 
338 aa  106  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0676  homoserine O-acetyltransferase  28.33 
 
 
399 aa  105  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  32.81 
 
 
488 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2096  homoserine O-acetyltransferase  39.6 
 
 
386 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2831  homoserine O-acetyltransferase  35.61 
 
 
407 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630893  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1759  homoserine O-acetyltransferase  28.16 
 
 
381 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3724  hypothetical protein  33 
 
 
355 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.994214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0583  homoserine O-acetyltransferase  32.31 
 
 
370 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0430  hypothetical protein  33.66 
 
 
359 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2134  homoserine O-acetyltransferase  32.5 
 
 
377 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06050  homoserine O-acetyltransferase  35.5 
 
 
376 aa  103  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.436257  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30795  homoserine O-acetyltransferase  30.25 
 
 
454 aa  103  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2278  hypothetical protein  28.9 
 
 
355 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2462  homoserine O-acetyltransferase  32.31 
 
 
368 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2783  homoserine O-acetyltransferase  28.57 
 
 
369 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.494213  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2039  homoserine O-acetyltransferase  37.11 
 
 
382 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0765159  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2638  hypothetical protein  32.65 
 
 
356 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12684  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1186  homoserine O-acetyltransferase  27.32 
 
 
407 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4182  hypothetical protein  30.21 
 
 
358 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221061  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1125  homoserine O-acetyltransferase  27.36 
 
 
381 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000197892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0752  homoserine O-acetyltransferase  26.74 
 
 
391 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00772131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4849  homoserine O-acetyltransferase  38.69 
 
 
374 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4925  homoserine O-acetyltransferase  26.75 
 
 
399 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0585  homoserine O-acetyltransferase  27.48 
 
 
399 aa  99.8  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2620  homoserine O-acetyltransferase  31.68 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  39.74 
 
 
490 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0929  homoserine O-acetyltransferase  40 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3407  homoserine O-acetyltransferase  35.15 
 
 
373 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  32.68 
 
 
579 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1108  homoserine O-acetyltransferase  31.19 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.333036 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3561  hypothetical protein  31.12 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1909  homoserine O-acetyltransferase  26.98 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.872712  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2563  homoserine O-acetyltransferase  25.32 
 
 
338 aa  97.8  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0977  homoserine O-acetyltransferase  39.24 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0514  homoserine O-acetyltransferase  30.65 
 
 
416 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.714605  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4099  homoserine O-acetyltransferase  26.46 
 
 
399 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08565  Putative serine O-acetyltransferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13389]  34.43 
 
 
517 aa  97.1  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.437172  normal  0.292436 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4562  homoserine O-acetyltransferase  38.32 
 
 
374 aa  97.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3500  homoserine O-acetyltransferase  31.09 
 
 
371 aa  97.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000120242  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2859  homoserine O-acetyltransferase  35.53 
 
 
364 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  30.16 
 
 
490 aa  96.3  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2822  homoserine O-acetyltransferase  35.67 
 
 
379 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0422  homoserine acetyltransferase  31.44 
 
 
392 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0905719  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0283  hypothetical protein  23.26 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99545  normal  0.0139101 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3002  homoserine O-acetyltransferase  30.82 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.92469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0349  homoserine O-acetyltransferase  30.26 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1023  homoserine O-acetyltransferase  26.46 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3266  homoserine O-acetyltransferase  30.05 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0393  homoserine O-acetyltransferase  38.69 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244956  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6236  hypothetical protein  31.63 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0969  homoserine O-acetyltransferase  38.85 
 
 
378 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0768373  normal  0.579179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0218  homoserine O-acetyltransferase  26.18 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.13468  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  24.24 
 
 
492 aa  94.4  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1978  homoserine O-acetyltransferase  25.92 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.77768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0329  homoserine O-acetyltransferase  30.26 
 
 
376 aa  94  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4873  homoserine O-acetyltransferase  37.5 
 
 
374 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3134  homoserine O-acetyltransferase  31.53 
 
 
387 aa  93.2  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289102  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1987  homoserine O-acetyltransferase  24.86 
 
 
388 aa  93.6  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0873301  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2096  homoserine O-acetyltransferase  29.38 
 
 
405 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1760  homoserine O-acetyltransferase  29.38 
 
 
405 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19560  homoserine O-acetyltransferase  27.13 
 
 
368 aa  92.8  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4629  homoserine O-acetyltransferase  36.9 
 
 
374 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.533677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4983  homoserine O-acetyltransferase  36.9 
 
 
374 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14330  homoserine O-acetyltransferase  35.22 
 
 
405 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>