281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2462 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2462  homoserine O-acetyltransferase  100 
 
 
368 aa  759    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2783  homoserine O-acetyltransferase  92.64 
 
 
369 aa  712    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.494213  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0583  homoserine O-acetyltransferase  84.7 
 
 
370 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3478  homoserine O-acetyltransferase  83.84 
 
 
367 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0188606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0329  homoserine O-acetyltransferase  82.74 
 
 
376 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115964 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0349  homoserine O-acetyltransferase  81.97 
 
 
367 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3500  homoserine O-acetyltransferase  78.18 
 
 
371 aa  615  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000120242  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0422  homoserine acetyltransferase  67.03 
 
 
392 aa  514  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0905719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0752  homoserine O-acetyltransferase  53.99 
 
 
391 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00772131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2039  homoserine O-acetyltransferase  53.39 
 
 
382 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0765159  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2134  homoserine O-acetyltransferase  53.93 
 
 
377 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  53.41 
 
 
490 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  49.45 
 
 
492 aa  391  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1759  homoserine O-acetyltransferase  52.03 
 
 
381 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  51.08 
 
 
491 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  50.4 
 
 
496 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  50 
 
 
488 aa  382  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1308  homoserine O-acetyltransferase  51.23 
 
 
374 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00994406  normal  0.346812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  51.1 
 
 
490 aa  377  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0842  homoserine O-acetyltransferase  49.45 
 
 
383 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0969  homoserine O-acetyltransferase  50.68 
 
 
378 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0768373  normal  0.579179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1470  homoserine O-acetyltransferase  49.45 
 
 
394 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1125  homoserine O-acetyltransferase  48.73 
 
 
381 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000197892  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1023  homoserine O-acetyltransferase  50.43 
 
 
394 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432777 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1427  homoserine O-acetyltransferase  48.66 
 
 
403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0338  homoserine O-acetyltransferase  48.12 
 
 
384 aa  352  5.9999999999999994e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4281  homoserine O-acetyltransferase  49.86 
 
 
400 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183607  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0275  homoserine O-acetyltransferase  46.7 
 
 
368 aa  352  7e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0293  homoserine O-acetyltransferase  47.57 
 
 
383 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0469  homoserine O-acetyltransferase  47.57 
 
 
383 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.239715  hitchhiker  0.0000710026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3266  homoserine O-acetyltransferase  47.24 
 
 
391 aa  348  9e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0764  homoserine O-acetyltransferase  46.35 
 
 
369 aa  346  5e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.549762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2480  homoserine O-acetyltransferase  46.11 
 
 
379 aa  344  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4099  homoserine O-acetyltransferase  49.31 
 
 
399 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4925  homoserine O-acetyltransferase  49.29 
 
 
399 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1581  homoserine O-acetyltransferase  48.63 
 
 
401 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.319374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4252  homoserine O-acetyltransferase  49.29 
 
 
400 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647342  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1089  homoserine O-acetyltransferase  49.58 
 
 
380 aa  340  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.740239  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  48.08 
 
 
487 aa  340  2e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1186  homoserine O-acetyltransferase  47.58 
 
 
407 aa  339  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0573  homoserine O-acetyltransferase  47.75 
 
 
410 aa  338  7e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1909  homoserine O-acetyltransferase  48.03 
 
 
406 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.872712  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0585  homoserine O-acetyltransferase  47.37 
 
 
399 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0980  homoserine O-acetyltransferase  45.08 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0949  homoserine O-acetyltransferase  47.86 
 
 
382 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0909  homoserine O-acetyltransferase  47.75 
 
 
368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19560  homoserine O-acetyltransferase  45.05 
 
 
368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2886  homoserine O-acetyltransferase  47.29 
 
 
373 aa  335  5e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3005  homoserine O-acetyltransferase  46.67 
 
 
378 aa  335  9e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3190  homoserine O-acetyltransferase  44.56 
 
 
394 aa  334  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1760  homoserine O-acetyltransferase  46.63 
 
 
405 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0385  homoserine O-acetyltransferase  48.88 
 
 
383 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.859111  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0613  homoserine O-acetyltransferase  47.16 
 
 
368 aa  333  3e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0191439  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2096  homoserine O-acetyltransferase  46.63 
 
 
405 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0676  homoserine O-acetyltransferase  48.43 
 
 
399 aa  333  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1534  homoserine O-acetyltransferase  46.63 
 
 
405 aa  332  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6450  homoserine O-acetyltransferase  45.58 
 
 
381 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2485  homoserine O-acetyltransferase  45.58 
 
 
381 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3099  homoserine O-acetyltransferase  45.58 
 
 
381 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3115  homoserine O-acetyltransferase  45.58 
 
 
381 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3096  homoserine O-acetyltransferase  45.31 
 
 
381 aa  332  9e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.867296  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0487  homoserine O-acetyltransferase  46.15 
 
 
369 aa  330  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0061  homoserine O-acetyltransferase  45.04 
 
 
381 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3037  homoserine O-acetyltransferase  45.04 
 
 
381 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3154  homoserine O-acetyltransferase  45.04 
 
 
381 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5049  homoserine O-acetyltransferase  45.14 
 
 
379 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4332  homoserine O-acetyltransferase  44.84 
 
 
385 aa  329  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0368  homoserine O-acetyltransferase  45.53 
 
 
379 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.626421  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6242  homoserine O-acetyltransferase  45.48 
 
 
411 aa  328  7e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0424143  normal  0.823707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3584  homoserine O-acetyltransferase  46.13 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382876  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3057  homoserine O-acetyltransferase  45.41 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.493314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0474  homoserine O-acetyltransferase  44.86 
 
 
379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.540112  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5323  homoserine O-acetyltransferase  44.99 
 
 
379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0157  homoserine O-acetyltransferase  45.31 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0929  homoserine O-acetyltransferase  48.24 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0532  homoserine O-acetyltransferase  44.5 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2058  homoserine O-acetyltransferase  43.01 
 
 
422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000028902  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1108  homoserine O-acetyltransferase  47.23 
 
 
399 aa  325  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.333036 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3246  homoserine O-acetyltransferase  45.04 
 
 
381 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0192  homoserine O-acetyltransferase  45.04 
 
 
381 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0377  homoserine O-acetyltransferase  45.04 
 
 
381 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0182  homoserine O-acetyltransferase  45.04 
 
 
381 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3441  homoserine O-acetyltransferase  45.04 
 
 
381 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.982618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2182  homoserine O-acetyltransferase  45.04 
 
 
381 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0962717  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2907  homoserine O-acetyltransferase  45.04 
 
 
381 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03040  homoserine O-acetyltransferase  46.18 
 
 
379 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1837  homoserine O-acetyltransferase  45.53 
 
 
403 aa  323  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4155  homoserine O-acetyltransferase  44.59 
 
 
379 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.915842 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2011  homoserine O-acetyltransferase  44.12 
 
 
379 aa  323  4e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0186  homoserine O-acetyltransferase  44.57 
 
 
390 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1879  homoserine O-acetyltransferase  45.4 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0268854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5288  homoserine O-acetyltransferase  45.26 
 
 
391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0727  homoserine O-acetyltransferase  47.2 
 
 
390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0406  homoserine O-acetyltransferase  43.85 
 
 
380 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1839  homoserine O-acetyltransferase  44.32 
 
 
385 aa  318  7e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0107828  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1728  homoserine O-acetyltransferase  43.85 
 
 
379 aa  318  7.999999999999999e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0027  homoserine O-acetyltransferase  44.86 
 
 
403 aa  318  9e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0130  homoserine O-acetyltransferase  44.99 
 
 
374 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4388  homoserine O-acetyltransferase  44.5 
 
 
381 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0335  homoserine O-acetyltransferase  43.97 
 
 
381 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>