266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2478 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2478  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  694    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0540594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1300  hypothetical protein  65.31 
 
 		 348 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0896  hypothetical protein  56.6 
 
 		 350 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.039913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0611  hypothetical protein  50.87 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1835  alpha/beta hydrolase fold protein  50.72 
 
 		 353 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0373  hypothetical protein  49.15 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3432  hypothetical protein  44.88 
 
 		 340 aa  282  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1589  alpha/beta hydrolase fold protein  43.49 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.643722  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3567  hypothetical protein  45.56 
 
 		 338 aa  271  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3685  hypothetical protein  45.27 
 
 		 338 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3376  hypothetical protein  45.27 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5507  hypothetical protein  44.67 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0036  hypothetical protein  45.1 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0026  hypothetical protein  45.1 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0045  hypothetical protein  45.1 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0127659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2372  alpha/beta hydrolase fold protein  43.28 
 
 		 345 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2369  alpha/beta hydrolase fold protein  42.64 
 
 		 348 aa  259  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4711  alpha/beta hydrolase fold protein  45.35 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0061  homoserine O-acetyltransferase  44.48 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1714  hypothetical protein  38.74 
 
 		 338 aa  229  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0598  hypothetical protein  41.3 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.693744  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5144  hypothetical protein  40.71 
 
 		 338 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.565819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0283  hypothetical protein  36.93 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99545  normal  0.0139101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7515  hypothetical protein  37.97 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2563  homoserine O-acetyltransferase  35.05 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.5124 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00875  homoserine acetyltransferase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G15350)  36.75 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.611267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3324  homoserine O-acetyltransferase  35.06 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0050  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 380 aa  152  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3918  homoserine O-acetyltransferase  29.97 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14330  homoserine O-acetyltransferase  31.41 
 
 		 405 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0051  homoserine O-acetyltransferase  30.23 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5345  homoserine O-acetyltransferase  27.74 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5434  homoserine O-acetyltransferase  27.74 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5724  homoserine O-acetyltransferase  27.88 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2859  homoserine O-acetyltransferase  31.13 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4076  homoserine O-acetyltransferase  31.17 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.66182  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0406  homoserine O-acetyltransferase  31.09 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1457  homoserine O-acetyltransferase  31.82 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2822  homoserine O-acetyltransferase  31.45 
 
 		 379 aa  119  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1125  homoserine O-acetyltransferase  28.81 
 
 		 381 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000197892  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2011  homoserine O-acetyltransferase  28.02 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0969  homoserine O-acetyltransferase  31.07 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0768373  normal  0.579179 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0977  homoserine O-acetyltransferase  29.48 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1728  homoserine O-acetyltransferase  31.19 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0182  homoserine O-acetyltransferase  30.92 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3246  homoserine O-acetyltransferase  30.92 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980024  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3441  homoserine O-acetyltransferase  30.92 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.982618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0192  homoserine O-acetyltransferase  30.92 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1076  homoserine O-acetyltransferase  30.45 
 
 		 357 aa  116  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000373874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2907  homoserine O-acetyltransferase  30.92 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2182  homoserine O-acetyltransferase  30.92 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0962717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0377  homoserine O-acetyltransferase  30.94 
 
 		 381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  29.91 
 
 		 488 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1089  homoserine O-acetyltransferase  29.52 
 
 		 380 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.740239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2430  homoserine O-acetyltransferase  30.33 
 
 		 745 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530876  normal  0.0849871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4876  homoserine O-acetyltransferase  31.32 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0157  homoserine O-acetyltransferase  30.92 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0609  homoserine O-acetyltransferase  30.25 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.110749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1186  homoserine O-acetyltransferase  30.67 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0321  homoserine O-acetyltransferase  29.65 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3096  homoserine O-acetyltransferase  31.15 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.867296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1909  homoserine O-acetyltransferase  29.01 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.872712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  29.21 
 
 		 490 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4905  homoserine O-acetyltransferase  30.25 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4254  homoserine O-acetyltransferase  30.67 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.218969  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3154  homoserine O-acetyltransferase  30.82 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1760  homoserine O-acetyltransferase  30.03 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.750038  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3037  homoserine O-acetyltransferase  30.82 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6450  homoserine O-acetyltransferase  30.82 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3483  homoserine O-acetyltransferase  27.89 
 
 		 379 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3115  homoserine O-acetyltransferase  30.49 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2485  homoserine O-acetyltransferase  30.49 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3099  homoserine O-acetyltransferase  30.49 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  29.97 
 
 		 491 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3005  homoserine O-acetyltransferase  28.33 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3057  homoserine O-acetyltransferase  29.45 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.493314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0061  homoserine O-acetyltransferase  29.55 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1759  homoserine O-acetyltransferase  31.58 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1400  homoserine dehydrogenase / homoserine O-acetyltransferase  30.46 
 
 		 745 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2480  homoserine O-acetyltransferase  29.46 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4102  homoserine O-acetyltransferase  30.16 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4125  homoserine O-acetyltransferase  28.53 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0585  homoserine O-acetyltransferase  30.79 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3723  homoserine O-acetyltransferase  28.85 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2553  homoserine O-acetyltransferase  30.15 
 
 		 744 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.897587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4252  homoserine O-acetyltransferase  31.05 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2457  homoserine O-acetyltransferase  30.15 
 
 		 744 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139099  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1361  homoserine O-acetyltransferase  30.45 
 
 		 371 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000465108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0930  homoserine O-acetyltransferase  29.14 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0676  homoserine O-acetyltransferase  30.52 
 
 		 399 aa  109  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4066  homoserine O-acetyltransferase  30.56 
 
 		 378 aa  109  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.685956  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3266  homoserine O-acetyltransferase  30.13 
 
 		 391 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0422  homoserine acetyltransferase  30.88 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0905719  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3400  homoserine O-acetyltransferase  28.2 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2039  homoserine O-acetyltransferase  31.4 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0147  homoserine O-acetyltransferase  28 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4281  homoserine O-acetyltransferase  30.1 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183607  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4889  homoserine O-acetyltransferase  28.39 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.490495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1318  homoserine O-acetyltransferase  31.33 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0437  homoserine O-acetyltransferase  27.56 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>