285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3561 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3561  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  804    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3724  hypothetical protein  83.43 
 
 
355 aa  609  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.994214  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0379  hypothetical protein  77.25 
 
 
359 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0430  hypothetical protein  78.35 
 
 
359 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2638  hypothetical protein  64.35 
 
 
356 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12684  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5780  hypothetical protein  54.8 
 
 
361 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6236  hypothetical protein  56.43 
 
 
363 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2278  hypothetical protein  46.67 
 
 
355 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4182  hypothetical protein  43.87 
 
 
358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221061  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4720  hypothetical protein  44.07 
 
 
366 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4548  hypothetical protein  43.64 
 
 
387 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4434  hypothetical protein  43.64 
 
 
387 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4067  hypothetical protein  43.33 
 
 
387 aa  289  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0050  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 
380 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4711  alpha/beta hydrolase fold protein  36.46 
 
 
338 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0180  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 
831 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9608 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1125  homoserine O-acetyltransferase  27.32 
 
 
381 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000197892  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  28.22 
 
 
488 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3918  homoserine O-acetyltransferase  32.43 
 
 
345 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0051  homoserine O-acetyltransferase  31.12 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1300  hypothetical protein  34.76 
 
 
348 aa  97.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00875  homoserine acetyltransferase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G15350)  34.5 
 
 
326 aa  96.7  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.611267 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3407  homoserine O-acetyltransferase  25.62 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2478  hypothetical protein  29.08 
 
 
345 aa  94.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0540594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3432  hypothetical protein  27.78 
 
 
340 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4873  homoserine O-acetyltransferase  24.26 
 
 
374 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0611  hypothetical protein  38.93 
 
 
347 aa  92  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0231125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7515  hypothetical protein  33.16 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1589  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
337 aa  90.1  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.643722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4867  homoserine O-acetyltransferase  24.53 
 
 
374 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2096  homoserine O-acetyltransferase  32.08 
 
 
405 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1760  homoserine O-acetyltransferase  32.08 
 
 
405 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3376  hypothetical protein  29.15 
 
 
338 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628493  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4849  homoserine O-acetyltransferase  23.39 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0977  homoserine O-acetyltransferase  29.25 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0393  homoserine O-acetyltransferase  24.26 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244956  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4629  homoserine O-acetyltransferase  23.12 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.533677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0752  homoserine O-acetyltransferase  28.06 
 
 
391 aa  86.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00772131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4983  homoserine O-acetyltransferase  23.12 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5507  hypothetical protein  38 
 
 
339 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2039  homoserine O-acetyltransferase  28.99 
 
 
382 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0765159  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3685  hypothetical protein  29.15 
 
 
338 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1308  homoserine O-acetyltransferase  34.33 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00994406  normal  0.346812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1759  homoserine O-acetyltransferase  29.29 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4562  homoserine O-acetyltransferase  23.92 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4843  homoserine O-acetyltransferase  23.99 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00942637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0676  homoserine O-acetyltransferase  30 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1879  homoserine O-acetyltransferase  35.29 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0268854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4463  homoserine O-acetyltransferase  23.12 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1534  homoserine O-acetyltransferase  31.4 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0583  homoserine O-acetyltransferase  30.77 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3190  homoserine O-acetyltransferase  25.86 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3567  hypothetical protein  31.05 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2620  homoserine O-acetyltransferase  28.7 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2134  homoserine O-acetyltransferase  32.8 
 
 
377 aa  84  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4482  homoserine O-acetyltransferase  22.85 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0373  hypothetical protein  34.85 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19560  homoserine O-acetyltransferase  28.88 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3400  homoserine O-acetyltransferase  31.58 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  27.27 
 
 
496 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0329  homoserine O-acetyltransferase  28.86 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4388  homoserine O-acetyltransferase  31.55 
 
 
381 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0585  homoserine O-acetyltransferase  29.41 
 
 
399 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3723  homoserine O-acetyltransferase  31.58 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4252  homoserine O-acetyltransferase  28.63 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647342  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2480  homoserine O-acetyltransferase  33.16 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0896  hypothetical protein  30.98 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.039913  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0283  hypothetical protein  25.82 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99545  normal  0.0139101 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2886  homoserine O-acetyltransferase  29.8 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0727  homoserine O-acetyltransferase  29.91 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2096  homoserine O-acetyltransferase  30.98 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6450  homoserine O-acetyltransferase  29.47 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0349  homoserine O-acetyltransferase  28.86 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2369  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1108  homoserine O-acetyltransferase  28.87 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.333036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0186  homoserine O-acetyltransferase  34.09 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0061  homoserine O-acetyltransferase  33.52 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1457  homoserine O-acetyltransferase  31.44 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1470  homoserine O-acetyltransferase  30.1 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2822  homoserine O-acetyltransferase  29.41 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1206  homoserine O-acetyltransferase  32.72 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3500  homoserine O-acetyltransferase  39.44 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000120242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0969  homoserine O-acetyltransferase  31.9 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0768373  normal  0.579179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0335  homoserine O-acetyltransferase  32.95 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3037  homoserine O-acetyltransferase  29.47 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0061  homoserine O-acetyltransferase  28.17 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4281  homoserine O-acetyltransferase  28.75 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183607  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  32.99 
 
 
491 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5144  hypothetical protein  32.61 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.565819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0406  homoserine O-acetyltransferase  31.44 
 
 
380 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2485  homoserine O-acetyltransferase  29.47 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3115  homoserine O-acetyltransferase  29.47 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3099  homoserine O-acetyltransferase  29.47 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0027  homoserine O-acetyltransferase  32.77 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4332  homoserine O-acetyltransferase  29.38 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3154  homoserine O-acetyltransferase  28.99 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1186  homoserine O-acetyltransferase  30 
 
 
407 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1835  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0598  hypothetical protein  36.84 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.693744  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0143  homoserine O-acetyltransferase  33.52 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>