268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0050 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0050  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
380 aa  786    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0051  homoserine O-acetyltransferase  67.84 
 
 
386 aa  517  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3432  hypothetical protein  31.86 
 
 
340 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2478  hypothetical protein  32.17 
 
 
345 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0540594 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0611  hypothetical protein  29.48 
 
 
347 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0231125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0061  homoserine O-acetyltransferase  31.02 
 
 
338 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0373  hypothetical protein  28.82 
 
 
359 aa  149  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1835  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1589  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
337 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.643722  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1300  hypothetical protein  29.74 
 
 
348 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3685  hypothetical protein  29.76 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3376  hypothetical protein  29.17 
 
 
338 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628493  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3567  hypothetical protein  29.17 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5507  hypothetical protein  29.59 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0026  hypothetical protein  28.78 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0036  hypothetical protein  28.78 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0045  hypothetical protein  28.78 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0127659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1470  homoserine O-acetyltransferase  28.38 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2372  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0896  hypothetical protein  29.94 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.039913  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2369  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1308  homoserine O-acetyltransferase  29.28 
 
 
374 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00994406  normal  0.346812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1759  homoserine O-acetyltransferase  28.77 
 
 
381 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4711  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  29.41 
 
 
491 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  30.38 
 
 
496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0598  hypothetical protein  28.74 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.693744  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0842  homoserine O-acetyltransferase  30.68 
 
 
383 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  28.25 
 
 
488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2039  homoserine O-acetyltransferase  28.49 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0765159  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1089  homoserine O-acetyltransferase  28.02 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.740239  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5144  hypothetical protein  29.12 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.565819 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1714  hypothetical protein  27.71 
 
 
338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0430  hypothetical protein  34.65 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4562  homoserine O-acetyltransferase  27.71 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4873  homoserine O-acetyltransferase  28.49 
 
 
374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2822  homoserine O-acetyltransferase  28.16 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2620  homoserine O-acetyltransferase  33.64 
 
 
408 aa  113  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3918  homoserine O-acetyltransferase  29.21 
 
 
345 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4867  homoserine O-acetyltransferase  28.29 
 
 
374 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0977  homoserine O-acetyltransferase  28.71 
 
 
366 aa  112  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2563  homoserine O-acetyltransferase  30.19 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0379  hypothetical protein  34.65 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1709  homoserine O-acetyltransferase  25.75 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.980413  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3724  hypothetical protein  34.65 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.994214  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  25.97 
 
 
490 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2859  homoserine O-acetyltransferase  30.42 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0393  homoserine O-acetyltransferase  27.84 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244956  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0752  homoserine O-acetyltransferase  25.81 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00772131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4629  homoserine O-acetyltransferase  27.35 
 
 
374 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.533677  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5780  hypothetical protein  29.25 
 
 
361 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4983  homoserine O-acetyltransferase  27.35 
 
 
374 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  25.34 
 
 
492 aa  109  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3002  homoserine O-acetyltransferase  31.5 
 
 
399 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.92469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4849  homoserine O-acetyltransferase  27.35 
 
 
374 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3561  hypothetical protein  34.16 
 
 
388 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1909  homoserine O-acetyltransferase  25.6 
 
 
406 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.872712  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2462  homoserine O-acetyltransferase  26.33 
 
 
368 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2783  homoserine O-acetyltransferase  26.88 
 
 
369 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.494213  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3407  homoserine O-acetyltransferase  27.16 
 
 
373 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3324  homoserine O-acetyltransferase  28.82 
 
 
339 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2278  hypothetical protein  29.77 
 
 
355 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6236  hypothetical protein  33.63 
 
 
363 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  28.1 
 
 
490 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0609  homoserine O-acetyltransferase  29.48 
 
 
436 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.110749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0218  homoserine O-acetyltransferase  26.1 
 
 
359 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.13468  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0583  homoserine O-acetyltransferase  30.1 
 
 
370 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1987  homoserine O-acetyltransferase  27.32 
 
 
388 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0873301  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7515  hypothetical protein  27.74 
 
 
341 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0349  homoserine O-acetyltransferase  25.88 
 
 
367 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0186  homoserine O-acetyltransferase  28.15 
 
 
390 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0338  homoserine O-acetyltransferase  26.72 
 
 
384 aa  106  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4843  homoserine O-acetyltransferase  28 
 
 
374 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00942637  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0969  homoserine O-acetyltransferase  28.69 
 
 
378 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0768373  normal  0.579179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1874  homoserine O-acetyltransferase  27.78 
 
 
352 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000788104  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2096  homoserine O-acetyltransferase  36.49 
 
 
386 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4482  homoserine O-acetyltransferase  26.78 
 
 
374 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4076  homoserine O-acetyltransferase  29 
 
 
359 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.66182  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0293  homoserine O-acetyltransferase  26.7 
 
 
383 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0329  homoserine O-acetyltransferase  25.88 
 
 
376 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115964 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14330  homoserine O-acetyltransferase  27.85 
 
 
405 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0469  homoserine O-acetyltransferase  26.7 
 
 
383 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.239715  hitchhiker  0.0000710026 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  30.13 
 
 
579 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3266  homoserine O-acetyltransferase  32.02 
 
 
391 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2831  homoserine O-acetyltransferase  33.77 
 
 
407 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630893  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13740  homoserine O-acetyltransferase  28.18 
 
 
377 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.316838  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4182  hypothetical protein  31.14 
 
 
358 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221061  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1427  homoserine O-acetyltransferase  27.83 
 
 
403 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0335  homoserine O-acetyltransferase  26.98 
 
 
381 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0514  homoserine O-acetyltransferase  32.18 
 
 
416 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.714605  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1125  homoserine O-acetyltransferase  25 
 
 
381 aa  103  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000197892  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4720  hypothetical protein  31.85 
 
 
366 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0929  homoserine O-acetyltransferase  38.34 
 
 
390 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4254  homoserine O-acetyltransferase  28.7 
 
 
414 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.218969  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06050  homoserine O-acetyltransferase  29.15 
 
 
376 aa  102  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.436257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1978  homoserine O-acetyltransferase  25.46 
 
 
400 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.77768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0944  homoserine O-acetyltransferase  32 
 
 
384 aa  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2134  homoserine O-acetyltransferase  33 
 
 
377 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3500  homoserine O-acetyltransferase  31.66 
 
 
371 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000120242  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4548  hypothetical protein  28.3 
 
 
387 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>