277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4182 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4182  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  741    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221061  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2278  hypothetical protein  56.27 
 
 
355 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5780  hypothetical protein  49.85 
 
 
361 aa  346  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0379  hypothetical protein  48.32 
 
 
359 aa  322  7e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0430  hypothetical protein  48.62 
 
 
359 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4720  hypothetical protein  46.53 
 
 
366 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4434  hypothetical protein  46.22 
 
 
387 aa  315  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4067  hypothetical protein  45.92 
 
 
387 aa  315  9e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4548  hypothetical protein  45.87 
 
 
387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3724  hypothetical protein  47.92 
 
 
355 aa  306  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.994214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6236  hypothetical protein  44.41 
 
 
363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2638  hypothetical protein  45.07 
 
 
356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12684  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3561  hypothetical protein  43.87 
 
 
388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0180  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
831 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4711  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
338 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0050  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
380 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1300  hypothetical protein  36.32 
 
 
348 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1589  alpha/beta hydrolase fold protein  31.98 
 
 
337 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.643722  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2134  homoserine O-acetyltransferase  28.09 
 
 
377 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0051  homoserine O-acetyltransferase  30.21 
 
 
386 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3407  homoserine O-acetyltransferase  26.06 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3918  homoserine O-acetyltransferase  26.72 
 
 
345 aa  96.3  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7515  hypothetical protein  30.69 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0583  homoserine O-acetyltransferase  28.78 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3432  hypothetical protein  28.06 
 
 
340 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2478  hypothetical protein  32.47 
 
 
345 aa  93.6  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0540594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5507  hypothetical protein  35.26 
 
 
339 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0329  homoserine O-acetyltransferase  32.34 
 
 
376 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115964 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0393  homoserine O-acetyltransferase  25.47 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244956  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4849  homoserine O-acetyltransferase  28.57 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1125  homoserine O-acetyltransferase  29.86 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000197892  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  28.62 
 
 
496 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1076  homoserine O-acetyltransferase  27.27 
 
 
357 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000373874  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0593  homoserine O-acetyltransferase  33.02 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0349  homoserine O-acetyltransferase  32.34 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4873  homoserine O-acetyltransferase  24.84 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4498  homoserine O-acetyltransferase  30.62 
 
 
379 aa  89.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202595  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  29.87 
 
 
492 aa  89.4  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0977  homoserine O-acetyltransferase  27.27 
 
 
366 aa  89.4  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3266  homoserine O-acetyltransferase  28.86 
 
 
391 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4843  homoserine O-acetyltransferase  24.45 
 
 
374 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00942637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4867  homoserine O-acetyltransferase  23.6 
 
 
374 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4562  homoserine O-acetyltransferase  26.4 
 
 
374 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00875  homoserine acetyltransferase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G15350)  31.14 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.611267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2462  homoserine O-acetyltransferase  30.73 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4629  homoserine O-acetyltransferase  27.75 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.533677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19560  homoserine O-acetyltransferase  25.16 
 
 
368 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0373  hypothetical protein  29.67 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2783  homoserine O-acetyltransferase  32.51 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.494213  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4983  homoserine O-acetyltransferase  27.75 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0820  homoserine O-acetyltransferase  26.87 
 
 
357 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.602432  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2039  homoserine O-acetyltransferase  28.72 
 
 
382 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0765159  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0585  homoserine O-acetyltransferase  25.72 
 
 
399 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0896  hypothetical protein  27.03 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.039913  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1308  homoserine O-acetyltransferase  30.46 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00994406  normal  0.346812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0598  hypothetical protein  28.35 
 
 
338 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.693744  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1759  homoserine O-acetyltransferase  28.52 
 
 
381 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0061  homoserine O-acetyltransferase  31.98 
 
 
338 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3478  homoserine O-acetyltransferase  29.21 
 
 
367 aa  86.3  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0188606  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3567  hypothetical protein  42.71 
 
 
338 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1879  homoserine O-acetyltransferase  28.1 
 
 
401 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0268854 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  25.47 
 
 
490 aa  86.3  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0676  homoserine O-acetyltransferase  26.18 
 
 
399 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5144  hypothetical protein  28.92 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.565819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3190  homoserine O-acetyltransferase  25.26 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3500  homoserine O-acetyltransferase  27.9 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000120242  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  25.59 
 
 
488 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4463  homoserine O-acetyltransferase  26.87 
 
 
374 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  25.84 
 
 
491 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0422  homoserine acetyltransferase  26.51 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0905719  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1089  homoserine O-acetyltransferase  27.83 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.740239  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3685  hypothetical protein  28.51 
 
 
338 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1457  homoserine O-acetyltransferase  32.64 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0437  homoserine O-acetyltransferase  26.97 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  26.45 
 
 
490 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2822  homoserine O-acetyltransferase  31.16 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0752  homoserine O-acetyltransferase  27.09 
 
 
391 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00772131  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0611  hypothetical protein  29 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0231125 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4482  homoserine O-acetyltransferase  26.43 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1470  homoserine O-acetyltransferase  23.89 
 
 
394 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2831  homoserine O-acetyltransferase  28.21 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630893  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3376  hypothetical protein  28.1 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628493  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3134  homoserine O-acetyltransferase  29.25 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289102  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1824  homoserine O-acetyltransferase  31.22 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1400  homoserine dehydrogenase / homoserine O-acetyltransferase  29.41 
 
 
745 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4254  homoserine O-acetyltransferase  28.64 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.218969  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2553  homoserine O-acetyltransferase  28.44 
 
 
744 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.897587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2457  homoserine O-acetyltransferase  28.44 
 
 
744 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139099  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1534  homoserine O-acetyltransferase  28.47 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4076  homoserine O-acetyltransferase  31.12 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.66182  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4252  homoserine O-acetyltransferase  30.21 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647342  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  27.56 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1186  homoserine O-acetyltransferase  30.96 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1760  homoserine O-acetyltransferase  28.1 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1108  homoserine O-acetyltransferase  25.94 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.333036 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0730  homoserine O-acetyltransferase  31.22 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2096  homoserine O-acetyltransferase  28.1 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1714  hypothetical protein  29.29 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13740  homoserine O-acetyltransferase  33.16 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.316838  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2620  homoserine O-acetyltransferase  26.39 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>