271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4252 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1186  homoserine O-acetyltransferase  84.86 
 
 
407 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0585  homoserine O-acetyltransferase  84 
 
 
399 aa  693    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4252  homoserine O-acetyltransferase  100 
 
 
400 aa  829    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647342  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4281  homoserine O-acetyltransferase  83.21 
 
 
400 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183607  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4099  homoserine O-acetyltransferase  90.98 
 
 
399 aa  757    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0676  homoserine O-acetyltransferase  84.5 
 
 
399 aa  696    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4925  homoserine O-acetyltransferase  90.93 
 
 
399 aa  751    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1909  homoserine O-acetyltransferase  74.67 
 
 
406 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.872712  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0573  homoserine O-acetyltransferase  72.03 
 
 
410 aa  588  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1023  homoserine O-acetyltransferase  73.35 
 
 
394 aa  587  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1534  homoserine O-acetyltransferase  73.33 
 
 
405 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1581  homoserine O-acetyltransferase  72.7 
 
 
401 aa  578  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.319374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1760  homoserine O-acetyltransferase  72.8 
 
 
405 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2096  homoserine O-acetyltransferase  72.8 
 
 
405 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1879  homoserine O-acetyltransferase  72.31 
 
 
401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0268854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1108  homoserine O-acetyltransferase  73.82 
 
 
399 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.333036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0727  homoserine O-acetyltransferase  73.3 
 
 
390 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3266  homoserine O-acetyltransferase  68.17 
 
 
391 aa  548  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0385  homoserine O-acetyltransferase  66.67 
 
 
383 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.859111  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3005  homoserine O-acetyltransferase  63.71 
 
 
378 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0437  homoserine O-acetyltransferase  65.1 
 
 
381 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2886  homoserine O-acetyltransferase  62.64 
 
 
373 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3134  homoserine O-acetyltransferase  62.98 
 
 
387 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289102  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0752  homoserine O-acetyltransferase  58.73 
 
 
391 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00772131  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0293  homoserine O-acetyltransferase  55.28 
 
 
383 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0469  homoserine O-acetyltransferase  55.28 
 
 
383 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.239715  hitchhiker  0.0000710026 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2134  homoserine O-acetyltransferase  57.02 
 
 
377 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  54.67 
 
 
490 aa  402  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  51.26 
 
 
492 aa  392  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1470  homoserine O-acetyltransferase  51.92 
 
 
394 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2039  homoserine O-acetyltransferase  54.85 
 
 
382 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0765159  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  51.83 
 
 
496 aa  386  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0338  homoserine O-acetyltransferase  52.04 
 
 
384 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1427  homoserine O-acetyltransferase  52.43 
 
 
403 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2480  homoserine O-acetyltransferase  53.82 
 
 
379 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  53.5 
 
 
488 aa  384  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  51.28 
 
 
491 aa  379  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1837  homoserine O-acetyltransferase  52.6 
 
 
403 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  51.85 
 
 
490 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1759  homoserine O-acetyltransferase  55.08 
 
 
381 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0489  homoserine O-acetyltransferase  50.7 
 
 
379 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4332  homoserine O-acetyltransferase  48.64 
 
 
385 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5323  homoserine O-acetyltransferase  51.45 
 
 
379 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3057  homoserine O-acetyltransferase  51.4 
 
 
402 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.493314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0368  homoserine O-acetyltransferase  51.59 
 
 
379 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.626421  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05080  homoserine O-acetyltransferase  50.42 
 
 
379 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3190  homoserine O-acetyltransferase  51.91 
 
 
394 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4155  homoserine O-acetyltransferase  51.71 
 
 
379 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.915842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0532  homoserine O-acetyltransferase  50.83 
 
 
382 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3483  homoserine O-acetyltransferase  50 
 
 
379 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4970  homoserine O-acetyltransferase  52.16 
 
 
379 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03040  homoserine O-acetyltransferase  50.56 
 
 
379 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0949  homoserine O-acetyltransferase  51.24 
 
 
382 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5288  homoserine O-acetyltransferase  49.45 
 
 
391 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5097  homoserine O-acetyltransferase  52.16 
 
 
379 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.611567  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0186  homoserine O-acetyltransferase  50.42 
 
 
390 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1839  homoserine O-acetyltransferase  51.27 
 
 
385 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0107828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5147  homoserine O-acetyltransferase  51.87 
 
 
379 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80559  normal  0.737785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0321  homoserine O-acetyltransferase  50.95 
 
 
377 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4125  homoserine O-acetyltransferase  49.59 
 
 
379 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6044  homoserine O-acetyltransferase  49.3 
 
 
382 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4102  homoserine O-acetyltransferase  49.73 
 
 
369 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4778  homoserine O-acetyltransferase  49.72 
 
 
376 aa  364  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2011  homoserine O-acetyltransferase  49.3 
 
 
379 aa  363  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3115  homoserine O-acetyltransferase  50.41 
 
 
381 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2058  homoserine O-acetyltransferase  49.19 
 
 
422 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000028902  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2485  homoserine O-acetyltransferase  50.41 
 
 
381 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3099  homoserine O-acetyltransferase  50.41 
 
 
381 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.999411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3584  homoserine O-acetyltransferase  51.12 
 
 
387 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382876  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6450  homoserine O-acetyltransferase  50.14 
 
 
381 aa  362  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0130  homoserine O-acetyltransferase  49.72 
 
 
374 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3037  homoserine O-acetyltransferase  50.14 
 
 
381 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0157  homoserine O-acetyltransferase  50.41 
 
 
381 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3096  homoserine O-acetyltransferase  50.14 
 
 
381 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.867296  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5049  homoserine O-acetyltransferase  50.29 
 
 
379 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3154  homoserine O-acetyltransferase  49.86 
 
 
381 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0474  homoserine O-acetyltransferase  50.29 
 
 
379 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.540112  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0406  homoserine O-acetyltransferase  49.45 
 
 
380 aa  359  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0221  homoserine O-acetyltransferase  48.76 
 
 
377 aa  359  5e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0375  homoserine O-acetyltransferase  44.42 
 
 
445 aa  359  6e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.864644 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0414  homoserine O-acetyltransferase  44.96 
 
 
472 aa  359  6e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0143  homoserine O-acetyltransferase  50.14 
 
 
390 aa  359  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0027  homoserine O-acetyltransferase  49.44 
 
 
403 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1728  homoserine O-acetyltransferase  48.47 
 
 
379 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0182  homoserine O-acetyltransferase  49.86 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3246  homoserine O-acetyltransferase  49.86 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980024  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0377  homoserine O-acetyltransferase  49.86 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3441  homoserine O-acetyltransferase  49.86 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.982618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0192  homoserine O-acetyltransferase  49.86 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2907  homoserine O-acetyltransferase  49.86 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2182  homoserine O-acetyltransferase  49.86 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0962717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3644  homoserine O-acetyltransferase  49.04 
 
 
381 aa  355  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4066  homoserine O-acetyltransferase  49.43 
 
 
378 aa  355  6.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.685956  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0147  homoserine O-acetyltransferase  49.15 
 
 
375 aa  355  7.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4889  homoserine O-acetyltransferase  48.08 
 
 
387 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.490495  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0583  homoserine O-acetyltransferase  49.72 
 
 
370 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0061  homoserine O-acetyltransferase  48.2 
 
 
381 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  49.57 
 
 
487 aa  353  2e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3723  homoserine O-acetyltransferase  48.61 
 
 
404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3400  homoserine O-acetyltransferase  48.61 
 
 
404 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>