More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5780 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5780  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  747    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2638  hypothetical protein  59.48 
 
 
356 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12684  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6236  hypothetical protein  59.26 
 
 
363 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3724  hypothetical protein  58.82 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.994214  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3561  hypothetical protein  54.8 
 
 
388 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0379  hypothetical protein  53.39 
 
 
359 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0430  hypothetical protein  53.03 
 
 
359 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4182  hypothetical protein  49.85 
 
 
358 aa  346  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221061  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4720  hypothetical protein  46.94 
 
 
366 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4548  hypothetical protein  50.3 
 
 
387 aa  325  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4434  hypothetical protein  49.7 
 
 
387 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4067  hypothetical protein  49.4 
 
 
387 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2278  hypothetical protein  46.13 
 
 
355 aa  324  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0180  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
831 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3432  hypothetical protein  30.64 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0050  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
380 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0051  homoserine O-acetyltransferase  35.29 
 
 
386 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3918  homoserine O-acetyltransferase  29.44 
 
 
345 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4711  alpha/beta hydrolase fold protein  28.48 
 
 
338 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  27.72 
 
 
496 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0061  homoserine O-acetyltransferase  28.98 
 
 
338 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7515  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2620  homoserine O-acetyltransferase  30.41 
 
 
408 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1589  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.643722  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00875  homoserine acetyltransferase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G15350)  34.64 
 
 
326 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.611267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1300  hypothetical protein  32.4 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1186  homoserine O-acetyltransferase  29.27 
 
 
407 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  26.73 
 
 
488 aa  90.1  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2478  hypothetical protein  30.56 
 
 
345 aa  89.4  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0540594 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2550  homoserine O-acetyltransferase  29.44 
 
 
433 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3500  homoserine O-acetyltransferase  27 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000120242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0977  homoserine O-acetyltransferase  27.67 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  25.69 
 
 
491 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0283  hypothetical protein  30.05 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99545  normal  0.0139101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4252  homoserine O-acetyltransferase  27.82 
 
 
400 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647342  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0585  homoserine O-acetyltransferase  31.28 
 
 
399 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1470  homoserine O-acetyltransferase  30.41 
 
 
394 aa  85.9  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  31.31 
 
 
579 aa  85.9  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1308  homoserine O-acetyltransferase  32.67 
 
 
374 aa  85.9  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00994406  normal  0.346812 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14330  homoserine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4281  homoserine O-acetyltransferase  27.82 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183607  normal  0.0783302 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08565  Putative serine O-acetyltransferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13389]  32.34 
 
 
517 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.437172  normal  0.292436 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1125  homoserine O-acetyltransferase  27.45 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000197892  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1097  homoserine O-acetyltransferase  32.81 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.076735  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1457  homoserine O-acetyltransferase  32.63 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0583  homoserine O-acetyltransferase  29.44 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1883  homoserine O-acetyltransferase  27.67 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3190  homoserine O-acetyltransferase  31.05 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0329  homoserine O-acetyltransferase  25.75 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0373  hypothetical protein  29.28 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4332  homoserine O-acetyltransferase  30.48 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0437  homoserine O-acetyltransferase  31.58 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2462  homoserine O-acetyltransferase  26.52 
 
 
368 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4099  homoserine O-acetyltransferase  26.83 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4254  homoserine O-acetyltransferase  33 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.218969  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  26.89 
 
 
490 aa  83.2  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0598  hypothetical protein  28.39 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.693744  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3134  homoserine O-acetyltransferase  29.94 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289102  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2096  homoserine O-acetyltransferase  29.03 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3407  homoserine O-acetyltransferase  25.64 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0676  homoserine O-acetyltransferase  28.69 
 
 
399 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4498  homoserine O-acetyltransferase  26.72 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202595  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06050  homoserine O-acetyltransferase  31.8 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.436257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0338  homoserine O-acetyltransferase  27.3 
 
 
384 aa  82.8  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0752  homoserine O-acetyltransferase  29.89 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00772131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3266  homoserine O-acetyltransferase  32.81 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2886  homoserine O-acetyltransferase  26.42 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2822  homoserine O-acetyltransferase  29.86 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4076  homoserine O-acetyltransferase  31.98 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.66182  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2369  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3005  homoserine O-acetyltransferase  27.18 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19560  homoserine O-acetyltransferase  27.92 
 
 
368 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1824  homoserine O-acetyltransferase  31.72 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0349  homoserine O-acetyltransferase  25.75 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1709  homoserine O-acetyltransferase  31.25 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.980413  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5144  hypothetical protein  28.22 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.565819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1987  homoserine O-acetyltransferase  30.87 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0873301  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0368  homoserine O-acetyltransferase  26.99 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.626421  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2480  homoserine O-acetyltransferase  29.41 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0611  hypothetical protein  28.04 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0231125 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2134  homoserine O-acetyltransferase  31.21 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  26.21 
 
 
492 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3002  homoserine O-acetyltransferase  29.28 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.92469  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2831  homoserine O-acetyltransferase  28.91 
 
 
407 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630893  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4925  homoserine O-acetyltransferase  27.89 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0067  homoserine O-acetyltransferase  25.91 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4562  homoserine O-acetyltransferase  25.07 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2859  homoserine O-acetyltransferase  31.43 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0474  homoserine O-acetyltransferase  28.88 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.540112  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5147  homoserine O-acetyltransferase  26.55 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80559  normal  0.737785 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0293  homoserine O-acetyltransferase  25.44 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0896  hypothetical protein  25.32 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.039913  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13740  homoserine O-acetyltransferase  25.84 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.316838  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0469  homoserine O-acetyltransferase  25.44 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.239715  hitchhiker  0.0000710026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1909  homoserine O-acetyltransferase  29.38 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.872712  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4843  homoserine O-acetyltransferase  24.29 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00942637  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1076  homoserine O-acetyltransferase  27.04 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000373874  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6044  homoserine O-acetyltransferase  29.47 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0613  homoserine O-acetyltransferase  28.5 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0191439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0393  homoserine O-acetyltransferase  24.21 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>