269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1978 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1978  homoserine O-acetyltransferase  100 
 
 
400 aa  827    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.77768  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02264  homoserine O-acetyltransferase  64.42 
 
 
477 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300596  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  37.15 
 
 
488 aa  250  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0393  homoserine O-acetyltransferase  37.43 
 
 
374 aa  250  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244956  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4867  homoserine O-acetyltransferase  38.24 
 
 
374 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4629  homoserine O-acetyltransferase  37.7 
 
 
374 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.533677  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4482  homoserine O-acetyltransferase  37.97 
 
 
374 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4983  homoserine O-acetyltransferase  37.7 
 
 
374 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4562  homoserine O-acetyltransferase  37.43 
 
 
374 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3407  homoserine O-acetyltransferase  38.07 
 
 
373 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4873  homoserine O-acetyltransferase  37.17 
 
 
374 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4463  homoserine O-acetyltransferase  37.17 
 
 
374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4843  homoserine O-acetyltransferase  36.63 
 
 
374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00942637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1125  homoserine O-acetyltransferase  36.84 
 
 
381 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000197892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4849  homoserine O-acetyltransferase  36.63 
 
 
374 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  38.1 
 
 
490 aa  230  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  35.4 
 
 
490 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  33.71 
 
 
491 aa  217  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  34.07 
 
 
492 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2039  homoserine O-acetyltransferase  34.17 
 
 
382 aa  215  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0765159  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0329  homoserine O-acetyltransferase  34.9 
 
 
376 aa  215  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115964 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1470  homoserine O-acetyltransferase  36.05 
 
 
394 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0349  homoserine O-acetyltransferase  34.6 
 
 
367 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0583  homoserine O-acetyltransferase  32.45 
 
 
370 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0422  homoserine acetyltransferase  32.76 
 
 
392 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0905719  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  32.05 
 
 
496 aa  206  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0842  homoserine O-acetyltransferase  32.89 
 
 
383 aa  205  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2462  homoserine O-acetyltransferase  32.89 
 
 
368 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1759  homoserine O-acetyltransferase  32.88 
 
 
381 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0752  homoserine O-acetyltransferase  32.64 
 
 
391 aa  202  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00772131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3478  homoserine O-acetyltransferase  33.72 
 
 
367 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0188606  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  32.06 
 
 
487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1308  homoserine O-acetyltransferase  31.48 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00994406  normal  0.346812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3500  homoserine O-acetyltransferase  31.58 
 
 
371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000120242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2783  homoserine O-acetyltransferase  32.59 
 
 
369 aa  196  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.494213  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19560  homoserine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
368 aa  196  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1427  homoserine O-acetyltransferase  33.43 
 
 
403 aa  193  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2134  homoserine O-acetyltransferase  30.83 
 
 
377 aa  192  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4155  homoserine O-acetyltransferase  32.78 
 
 
379 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.915842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0406  homoserine O-acetyltransferase  33.14 
 
 
380 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2480  homoserine O-acetyltransferase  33.43 
 
 
379 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1089  homoserine O-acetyltransferase  34.52 
 
 
380 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.740239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0977  homoserine O-acetyltransferase  32.02 
 
 
366 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0949  homoserine O-acetyltransferase  30.89 
 
 
382 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2620  homoserine O-acetyltransferase  31.23 
 
 
408 aa  186  7e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6044  homoserine O-acetyltransferase  31.87 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0469  homoserine O-acetyltransferase  29.17 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.239715  hitchhiker  0.0000710026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0969  homoserine O-acetyltransferase  32.77 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0768373  normal  0.579179 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1076  homoserine O-acetyltransferase  36.34 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000373874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3190  homoserine O-acetyltransferase  32.1 
 
 
394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0293  homoserine O-acetyltransferase  29.17 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1023  homoserine O-acetyltransferase  32.16 
 
 
394 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3483  homoserine O-acetyltransferase  32.26 
 
 
379 aa  184  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0147  homoserine O-acetyltransferase  31.96 
 
 
375 aa  182  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2886  homoserine O-acetyltransferase  32.36 
 
 
373 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4125  homoserine O-acetyltransferase  31.96 
 
 
379 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4778  homoserine O-acetyltransferase  32.16 
 
 
376 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  40.36 
 
 
579 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0338  homoserine O-acetyltransferase  29.48 
 
 
384 aa  180  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3584  homoserine O-acetyltransferase  31.13 
 
 
387 aa  180  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382876  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3266  homoserine O-acetyltransferase  30.98 
 
 
391 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05080  homoserine O-acetyltransferase  32.51 
 
 
379 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4388  homoserine O-acetyltransferase  33.03 
 
 
381 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0061  homoserine O-acetyltransferase  31.38 
 
 
381 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0368  homoserine O-acetyltransferase  31.32 
 
 
379 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.626421  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03040  homoserine O-acetyltransferase  30.3 
 
 
379 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5049  homoserine O-acetyltransferase  31.2 
 
 
379 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0532  homoserine O-acetyltransferase  32.3 
 
 
382 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0182  homoserine O-acetyltransferase  31.09 
 
 
381 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3246  homoserine O-acetyltransferase  31.09 
 
 
381 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0192  homoserine O-acetyltransferase  31.09 
 
 
381 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3441  homoserine O-acetyltransferase  31.09 
 
 
381 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.982618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2907  homoserine O-acetyltransferase  31.09 
 
 
381 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2182  homoserine O-acetyltransferase  31.09 
 
 
381 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0962717  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4925  homoserine O-acetyltransferase  31.09 
 
 
399 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4076  homoserine O-acetyltransferase  32.92 
 
 
359 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.66182  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1108  homoserine O-acetyltransferase  31.96 
 
 
399 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.333036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1534  homoserine O-acetyltransferase  32.34 
 
 
405 aa  176  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0489  homoserine O-acetyltransferase  31.68 
 
 
379 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0980  homoserine O-acetyltransferase  30.03 
 
 
372 aa  176  7e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0474  homoserine O-acetyltransferase  31.2 
 
 
379 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.540112  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1760  homoserine O-acetyltransferase  32.05 
 
 
405 aa  176  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2096  homoserine O-acetyltransferase  32.05 
 
 
405 aa  176  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0377  homoserine O-acetyltransferase  30.79 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0335  homoserine O-acetyltransferase  31.32 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1097  homoserine O-acetyltransferase  30.18 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.076735  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4970  homoserine O-acetyltransferase  32.42 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5288  homoserine O-acetyltransferase  31.87 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0573  homoserine O-acetyltransferase  31.09 
 
 
410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0585  homoserine O-acetyltransferase  30.79 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13740  homoserine O-acetyltransferase  33.78 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.316838  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1909  homoserine O-acetyltransferase  30.86 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.872712  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0275  homoserine O-acetyltransferase  31.36 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5097  homoserine O-acetyltransferase  32.69 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.611567  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0157  homoserine O-acetyltransferase  30.79 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3096  homoserine O-acetyltransferase  30.79 
 
 
381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.867296  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6450  homoserine O-acetyltransferase  30.79 
 
 
381 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3644  homoserine O-acetyltransferase  29.36 
 
 
381 aa  173  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0676  homoserine O-acetyltransferase  30.79 
 
 
399 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5323  homoserine O-acetyltransferase  30.9 
 
 
379 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>