51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0485 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0485  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 73 aa  144  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.477053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0448  Heavy metal transport/detoxification protein  94.52 
 
 		 73 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.268812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0415  heavy metal transport/detoxification protein  94.52 
 
 		 73 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  67.65 
 
 		 81 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  66.18 
 
 		 80 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  63.01 
 
 		 73 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  41.82 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  38.71 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  40.3 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 818 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0408  hypothetical protein  38.98 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000230942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0449  hypothetical protein  38.98 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68228e-19 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0389  hypothetical protein  38.98 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0394  hypothetical protein  38.98 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593872  hitchhiker  1.762e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0386  hypothetical protein  38.98 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000012087 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  32.26 
 
 		 759 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  32.26 
 
 		 759 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 68 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0557  heavy metal transport/detoxification protein  40.38 
 
 		 56 aa  41.6  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 68 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  30.65 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  35 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  32.2 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3072  Heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.356914 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 783 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  32.2 
 
 		 64 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 814 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  35 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0643  hypothetical protein  33.9 
 
 		 67 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 755 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>