More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3657 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3657  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
420 aa  837    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.19 
 
 
418 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.335105  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.25 
 
 
418 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
382 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 
399 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
410 aa  193  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2653  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
414 aa  193  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.32 
 
 
887 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  34.92 
 
 
369 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0105  alcohol dehydrogenase  36.45 
 
 
408 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.535582  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 
395 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 
389 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
395 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4998  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
409 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339294  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
388 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  30.07 
 
 
872 aa  177  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
388 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 
368 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
399 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
384 aa  173  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4504  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
867 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
389 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
388 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.85 
 
 
382 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 
393 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4453  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
867 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.657364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4115  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
867 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4490  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
867 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0746  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
867 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1495  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
863 aa  170  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4104  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
867 aa  170  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4451  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
867 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  32.1 
 
 
381 aa  169  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4267  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
867 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4599  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
867 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.77 
 
 
382 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.1 
 
 
376 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  30.77 
 
 
382 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  32.8 
 
 
382 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.79 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  33.16 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  32.54 
 
 
382 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 
383 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  32.01 
 
 
382 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  32.28 
 
 
382 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  32.28 
 
 
382 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0772  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 
887 aa  166  8e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  32.22 
 
 
387 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  32.28 
 
 
382 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  32.28 
 
 
382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  32.28 
 
 
382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4218  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.28 
 
 
867 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277718  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.07 
 
 
387 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  32.28 
 
 
382 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
402 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
385 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 
386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
387 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.94 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
385 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
383 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
387 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 
387 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.62 
 
 
390 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
371 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
392 aa  160  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  29 
 
 
387 aa  159  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 
382 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4732  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 
399 aa  159  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.942125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
382 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.58 
 
 
393 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
383 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
382 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.17 
 
 
386 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0904  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
386 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.09 
 
 
392 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  29.14 
 
 
385 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.89 
 
 
383 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  29.14 
 
 
385 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 
390 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 
376 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 
387 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
382 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
382 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2043  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.35 
 
 
858 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
377 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
382 aa  156  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>